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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000635`

染色体: Chr06 坐标: 5607933-5612560 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000635`
名称	SmilChr06G000635
描述	protein PHOX1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5607933 - 5612560 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988181`
GeneID	`130988181`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988181`
原始查询	`SmilChr06G000635`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHOX1-like
产物	protein PHOX1-like
Arabidopsis	`AT2G25290` (Phox1) Octicosapeptide/Phox/Bem1p (PB1) domain-containing protein / tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817067] identity=50.1; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0556200` - identity=54; qcov=0.625; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988181

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057767945.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057767945.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057767945.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767945.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5609637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:5609849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C28
`Chr6:5609910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:5609945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:5609952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B68
`Chr6:5609956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B56,B96,C20
`Chr6:5609966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5610324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:5610390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:5610459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B82,C75
`Chr6:5610475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:5610492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767945.1

726 aa

363

726

PB1

PF00564 PB1 274-349 aa

XP_057767946.1

726 aa

363

726

PB1

PF00564 PB1 274-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767945.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	274	349	8.2e-12	45.6	PB1 domain
`XP_057767946.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	274	349	8.2e-12	45.6	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911962.1
TTTCCACTTTCTCCTAGAGTTGCTATGTTAATTGTCCACTGAAATTATACTATATCTATGGTATATATAGGCTATTTACTATAGCGCTATTCAAAATTTGGGAGGTATTTATTAATGTATGAGGAACATATTTAGATGTATTTGAATGCACTAGAGACTAGAGTGCATCCATCCTAGCTAACTGTGATTAGTAAATTCATATTGTAAAATAATAAATCAAACATATATAGAAACTAATAATTTTAATAGAAATTAATGAA...

XM_057911963.1
CTTTCTCCTAGAGTTGCTATGTTAATTGTCCACTGAAATTATACTATATCTATGGTATATATAGGCTATTTACTATAGCGCTATTCAAAATTTGGGAGGTATTTATTAATGTATGAGGAACATATTTAGATGTATTTGAATGCACTAGAGACTAGAGTGCATCCATCCTAGCTAACTGTGATTAGTAAATTCATATTGTAAAATAATAAATCAAACATATATAGAAACTAATAATTTTAATAGAAATTAATGAATTCTAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988181
ATGGAGAACCAAAGTGAAACAGACAAGAGCCGTTCTGGCGATAAATGGCGTGAGATATATTTGAGGAAAATGAGAAATAGCGATAATAGCCAGAGACATTATGATATAGATACAGCTGCATTCATGTCAATGTCTCAGAAATTGAAAGAGGATGGCAATAGGCTTTTCCAAAAGAGGGATTATGGGGGTGCCATCTTAAAATACGATAAATCCATCAAGTTGCTGCCGAGATTCCACGCAGATGTGGCGTATCTGAGGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767945.1
MENQSETDKSRSGDKWREIYLRKMRNSDNSQRHYDIDTAAFMSMSQKLKEDGNRLFQKRDYGGAILKYDKSIKLLPRFHADVAYLRSNMAECYMQLGVGEYSRAIDECNLALEVIPNYCKALLKRARCYETLHRPDLALRDIRLVLKSEPNNLMASEIEERLRRVFERQGSRLSDIPNDLVPLPDYTDSPSSSESRGVGEMSMKKKRNNLDGKRVDGMFEDYNEERELKGKFEERTASSIYIRAPSSRAEKNTEDKVVVE...

XP_057767946.1
MENQSETDKSRSGDKWREIYLRKMRNSDNSQRHYDIDTAAFMSMSQKLKEDGNRLFQKRDYGGAILKYDKSIKLLPRFHADVAYLRSNMAECYMQLGVGEYSRAIDECNLALEVIPNYCKALLKRARCYETLHRPDLALRDIRLVLKSEPNNLMASEIEERLRRVFERQGSRLSDIPNDLVPLPDYTDSPSSSESRGVGEMSMKKKRNNLDGKRVDGMFEDYNEERELKGKFEERTASSIYIRAPSSRAEKNTEDKVVVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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