当前解析结果
SmilChr06G000638| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000638 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000638 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000638 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 5647185 - 5648867 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990399 |
|---|---|
| GeneID | 130990399 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990399 |
| 原始查询 | SmilChr06G000638 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os08g0208400- identity=40.5; qcov=1.03; evalue=3.72e-130; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990399 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770620.1 |
| 2 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057770620.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770620.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770620.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770620.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057770620.1PF13963
Transpos_assoc 3-77 aa
PF02992
Transposase_21 290-499 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057770620.1 |
Pfam | PF13963 |
Transpos_assoc | Domain | 3 | 77 | 1.8e-19 | 70.3 | Transposase-associated domain |
XP_057770620.1 |
Pfam | PF02992 |
Transposase_21 | Family | 290 | 499 | 4.7e-98 | 327.3 | Transposase family tnp2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。