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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000640`

染色体: Chr06 坐标: 5657179-5660413 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000640`
名称	SmilChr06G000640
描述	heparanase-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5657179 - 5660413 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988186`
GeneID	`130988186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988186`
原始查询	`SmilChr06G000640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heparanase-like protein 3
产物	heparanase-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G34940` (GUS3) glucuronidase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833437] identity=58.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0802200` - identity=60.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004566 (beta-glucuronidase activity); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00531 (Glycosaminoglycan degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03662 (Glyco_hydro_79n)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057767951.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057767951.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057767952.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767951.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5657624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C52
`Chr6:5658483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:5658528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,B71,C62
`Chr6:5658717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C40
`Chr6:5658937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C30
`Chr6:5659201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C31,C4,C57,C6,D9
`Chr6:5659216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr6:5659219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:5659221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr6:5659261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B40
`Chr6:5659351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B40
`Chr6:5659949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767951.1

533 aa

266

533

Glyco_hydro_79n

PF03662 Glyco_hydro_79n 28-342 aa

XP_057767952.1

446 aa

223

446

Glyco_hydro_79n

PF03662 Glyco_hydro_79n 3-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767951.1`	Pfam	`PF03662`	Glyco_hydro_79n	Domain	28	342	1.8e-153	510.9	Glycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain
`XP_057767952.1`	Pfam	`PF03662`	Glyco_hydro_79n	Domain	3	255	6.7e-117	390.8	Glycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911968.1
TCTTTGACACTTTTGTGAAGCAAAGCACATTTTTGAACTGGCCCACTGCAACCAACTTTGATAATACACACACAATACACACACATTTTTAAGAGTTGTTTCCCACACCATAAAGGAAAGCATCACGAAAGTCTTGAATTTACTTGCACTTATTAGCTCAAATAAAGCTGCTCTTAACTCCATAAATGTCTCATAATCTTTGTCAATCTTCATTTGCAGTAGTTTAGTACTGTAGGGCCCTTATTCTCTGCTCAATGTTA...

XM_057911969.1
GCCCATTGCAAATACAGATGATGATTTCATTTGTGCAACTTTGGATTGGTGGCCACCTGAGAAGTGTGATTATGGGACTTGTAGCTGGGGCCATGCTTCTCTGCTCAACTTGGATCTCAAGAATACAGTCTTCCTAAATGCTGTTAAAGATCAGATTGGGTGGCACCTTGCAAGACAAAGTCATCTACGAGACAGAAGACGAATCACAGCCCTGCATTCCGTTCGCCAAGAACTCTTCCATCATGTTCGGTTTCACCAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988186
ATGGGTTCTTTGGTTTTACAAATGGGGTGGTGGGTGTTGGTGGTGTGTGTGAGCTATGTGCAGGCTATTGTGAGCATTGAAGGCAGTGTTTTTATTGATGGGAAGATGCCCATTGCAAATACAGATGATGATTTCATTTGTGCAACTTTGGATTGGTGGCCACCTGAGAAGTGTGATTATGGGACTTGTAGCTGGGGCCATGCTTCTCTGCTCAACTTGGATCTCAAGAATACAGTCTTCCTAAATGCTGTTAAAGCATT...

LOC130988186
ATGCTGTTAAAGATCAGATTGGGTGGCACCTTGCAAGACAAAGTCATCTACGAGACAGAAGACGAATCACAGCCCTGCATTCCGTTCGCCAAGAACTCTTCCATCATGTTCGGTTTCACCAATGGCTGCCTGCCATTGTCTAGATGGGATGAGCTGAATTCCTTCTTCAATGAATCAGGGGCTCTTGTTGTTTTCGGATTGAATGCTCTACGTGGAAAGTCTATACAATCTGGTACTGCAGTAGGCCCGTGGGATTACAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057767951.1
MGSLVLQMGWWVLVVCVSYVQAIVSIEGSVFIDGKMPIANTDDDFICATLDWWPPEKCDYGTCSWGHASLLNLDLKNTVFLNAVKAFSPLKIRLGGTLQDKVIYETEDESQPCIPFAKNSSIMFGFTNGCLPLSRWDELNSFFNESGALVVFGLNALRGKSIQSGTAVGPWDYTNAASLIRYTVKKGYKIYGWELGNELSGRGIGVGISADQYASDTVALHDLVEEIYKEVDIRPQIIAPGGFFDAGWFQQFLAKTVGSV...

XP_057767952.1
MLLKIRLGGTLQDKVIYETEDESQPCIPFAKNSSIMFGFTNGCLPLSRWDELNSFFNESGALVVFGLNALRGKSIQSGTAVGPWDYTNAASLIRYTVKKGYKIYGWELGNELSGRGIGVGISADQYASDTVALHDLVEEIYKEVDIRPQIIAPGGFFDAGWFQQFLAKTVGSVDVITHHIYNLGPGSDEHLVDRILNPSVLESGGDVFRNLHNVVRTSPNSAAAWVGEAGGAYNSGHDGVTNAFVFSFWYLDQLGRSSTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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