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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000646`

染色体: Chr06 坐标: 5706291-5711906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000646`
名称	SmilChr06G000646
描述	jasmonate-induced oxygenase 4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5706291 - 5711906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990401`
GeneID	`130990401`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990401`
原始查询	`SmilChr06G000646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	jasmonate-induced oxygenase 4-like
产物	jasmonate-induced oxygenase 4-like
Arabidopsis	`AT1G49390` (AT1G49390) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841362] identity=45; qcov=0.798; evalue=2.05e-74; confidence=high
Rice	`Os06g0176700` (OsHSL1) - identity=41.7; qcov=0.842; evalue=2.51e-70; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990401

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770622.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770622.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5706298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:5706321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C2,C32,C68
`Chr6:5706332`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A10,A15,A20,B107,B114,B115,B125,B140,B17,B26,B31,B38,B39,B40,B41,B44,B48,B64,B65,B66,B71,B75,B76,B8,B9,B90,B92,B97,C13,C20,C3,C38,C44,C47,C5,C54,C77,C79,C85
`Chr6:5706335`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B91,C27,C31,C56,C65,C71,C80,D10
`Chr6:5706388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D6
`Chr6:5706405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B103,B108,B122,B126,B22,B36,B81,B95,C2,C32,C40,C41,C49,C68,C79,C9,D10
`Chr6:5706416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D6
`Chr6:5706430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A2,B59,C35,C42
`Chr6:5706458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B82,C75
`Chr6:5706477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr6:5706477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:5706583`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770622.1

342 aa

171

342

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 32-139 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 189-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770622.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	32	139	1.6e-23	84.3	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057770622.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	189	285	1.1e-28	100.2	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914639.1
ATGGCCGGAGACTTGGCAAAACAAGAAGGGCTTGGAAGTGAAATTGACAAGGATGAGCAGCTAATTCCACTCACTGTTCCTTTGGCTGCAGAAATTCCGGTGGTCGACCTCCGCCGATTGCTTGCCGCCTCCACTGATGCCGGCCTCTCCGACCTCCGCTCCGCTCTCAGCTCCTGGGGTTGCTTTCAGGTAGTAAATCATGGCATTGAAAGCTCTGTACTAGCTGAGGTGCGCCGCATCAGCAGAGAATTCTTTGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990401
ATGGCCGGAGACTTGGCAAAACAAGAAGGGCTTGGAAGTGAAATTGACAAGGATGAGCAGCTAATTCCACTCACTGTTCCTTTGGCTGCAGAAATTCCGGTGGTCGACCTCCGCCGATTGCTTGCCGCCTCCACTGATGCCGGCCTCTCCGACCTCCGCTCCGCTCTCAGCTCCTGGGGTTGCTTTCAGGTAGTAAATCATGGCATTGAAAGCTCTGTACTAGCTGAGGTGCGCCGCATCAGCAGAGAATTCTTTGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770622.1
MAGDLAKQEGLGSEIDKDEQLIPLTVPLAAEIPVVDLRRLLAASTDAGLSDLRSALSSWGCFQVVNHGIESSVLAEVRRISREFFELPMSEKHKYAGAEVDQGYGTDQPVADDQFPDCSHYLRLRIFPEDRRNPIYWPQNPDSFREVLVEYSDKLRGVAEEILKLTGKSLKLGDEESFVKKTSVMHAQFNYYPPCPNPDRVIGLRQHSDCSVITILLQADQVEGLQLLKDDNWLAAPIMPHALFVFAGDQLQIMSNGILK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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