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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000650`

染色体: Chr06 坐标: 5748463-5751841 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000650`
名称	SmilChr06G000650
描述	uncharacterized SmilChr06G000650
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5748463 - 5751841 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990402`
GeneID	`130990402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990402`
原始查询	`SmilChr06G000650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=40.6; qcov=0.497; evalue=1.27e-81; confidence=medium
Rice	`Os07g0423000` - identity=30.4; qcov=0.49; evalue=9.94e-46; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770623.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057770623.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770623.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770623.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5748573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B128,B138,B19,C65
`Chr6:5748785`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A1,A14,B109,B110,B115,B130,B134,B14,B17,B28,B29,B57,B67,B74,B93,B99,C18,C36,C43,C45,C68,C74
`Chr6:5748873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A2,B59,C35
`Chr6:5748894`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,B14
`Chr6:5748894`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B110,B14
`Chr6:5748895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B134,B67,B93
`Chr6:5748896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B134,B67,B93
`Chr6:5748922`	`ACC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	C35,C59,C64,C81
`Chr6:5748964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:5749846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C44
`Chr6:5749856`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A18,B101,B16,B83,C35,C59,C64,C66,C81
`Chr6:5750202`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B109,B115,B129,B20,B29,B58,B67,B86,B93,B99,C14,C18,C34,C36,C37,C44,C45,C51,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770623.1

698 aa

349

698

mTERF

PF02536 mTERF 75-284 aa PF02536 mTERF 242-349 aa PF02536 mTERF 429-525 aa PF02536 mTERF 555-666 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770623.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	75	284	5.2e-71	239.9	mTERF
`XP_057770623.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	242	349	5.2e-71	239.9	mTERF
`XP_057770623.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	429	525	5.2e-71	239.9	mTERF
`XP_057770623.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	555	666	5.2e-71	239.9	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914640.1
ACGTATGCCTCTTTATAATGGGATGGCGTAGCAGACAGATTGCCGGGCTCGGTAGCGCGAGCCTGTGACCTAAGCAGGGGCATTAAGGCGGGATCGGAGGTTGCAGTGGTGGAAGGAGGAGGAGGGCGGACTTAGTCCGAAACCCGTGCTGAACTTGGCCCCACATCAGGGATTCTAGCTCGATTGTCGAGCGGATTGGAATCGAGGCTCTCATAGAGAGATGAACCGGCTCGTTTGACGAGTTGCGGGATGGCGTCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990402
ATGCTGGCTGCAATTTTGTGTAGGAGAATAGTGAGCGCGCCCAGAAAAGATGGTATCTTTTCCCTCTCCTCCTCCCGCAAATCACACTCCGACGGCGGCGGAGGCGGCGGCGCAACTTTCACCATTTCATACCTCACCAAGTCATGTGGGCTATCCTTGAAAGACGCCGTCTCCGTCTCCAAGAAACTGCGCATCAAATCGCGACACAACCCAGATGCGGTGTTGGATCTCCTCACCGATTTCGGATTCACAAACGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770623.1
MLAAILCRRIVSAPRKDGIFSLSSSRKSHSDGGGGGGATFTISYLTKSCGLSLKDAVSVSKKLRIKSRHNPDAVLDLLTDFGFTNAQISKLVTKWPLVLQSHADETLLPKLEFLRSIGVPAAVAAQKLTVYPMILQRSLENSLIPTYNYLKNLLQSDKKVVNVFARAPRAFVHGCCGEMSRNIAILRERGAPESSIALLLNNQPSLLMLGGEAFAALVDRAVEMGFDVSKVIFVLALQVFANMSESTLQRKMGVYRRCGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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