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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000652`

染色体: Chr06 坐标: 5754538-5755796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000652`
名称	SmilChr06G000652
描述	uncharacterized SmilChr06G000652
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5754538 - 5755796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988197`
GeneID	`130988197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988197`
原始查询	`SmilChr06G000652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=39.5; qcov=0.837; evalue=2.18e-39; confidence=medium
Rice	`Os07g0423000` - identity=29.5; qcov=0.828; evalue=6.11e-26; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767960.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767960.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767960.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767960.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5755147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:5755167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A24,A5,A7,B137,B98,C4,D5
`Chr6:5755221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B120
`Chr6:5755246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr6:5755360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C87
`Chr6:5755433`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,C82
`Chr6:5755433`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr6:5755436`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,B74
`Chr6:5755436`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B104,B74
`Chr6:5755437`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A11,A14,A19,A2,A21,B1,B10,B102,B107,B113,B119,B12,B120,B129,B131,B132,B133,B136,B138,B18,B20,B23,B25,B29,B36,B46,B48,B55,B61,B66,B68,B7,B72,B76,B78,B79,B81,B84,B86,B91,B94,B97,C14,C15,C2,C22,C23,C33,C34,C39,C55,C57,C58,C61,C62,C75,C76,D3,D4
`Chr6:5755464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B10
`Chr6:5755464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767960.1

221 aa

110

221

mTERF

PF02536 mTERF 30-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767960.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	30	185	3e-21	76.4	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911977.1
GCAGTAATTTTGTTTTGGCTCGTTCTCCCTCGTCCGAACTCCGATTTACAAACCGTTTGCGCTCACGAACTCCTCTCGAGACGATATACAACTTGTATTTCAGCTAATTCTTCCAAATTTTGCTTCATTATTTCTGAAAATTCGTTCAAACAACGAGCAAGTAACAAGTTCTTGATCATAAACTAATATAAGCTCAAATAAACCATCAAACACACAAAATCCTCATAACTAAACATCAAATATGACACACCAAGAGGTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988197
ATGTTTATCAGTGTTTCTCAGCAGTCCAAGGGCGTTCACACACGGCTGGCCAGAAAGGATTCCTTCCAACATCGGTATTCTGAGAGAGAGAGAGGGGTACCCGAGTCTTCAATCATTTCGTTGATAGTGAACAAGCCATCGATGATGATTCTGAAACAGGACAAGTTCGGCGCCTGTGTTGATCGGGCTGCCGAATTGGGACTCGCGCCGTCGAAGGTTGTGTTCGTTCGCGCCCTCCAAGCGTTCGGTAGATTGTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767960.1
MFISVSQQSKGVHTRLARKDSFQHRYSERERGVPESSIISLIVNKPSMMILKQDKFGACVDRAAELGLAPSKVVFVRALQAFGRLSESTVKHKMDVYRRCGWSECDLNAAFLRHPLCLKLSQKKIRRNMDFLVKEMRMKASEVAQCPSVLDYNCDTRMRPRWMVVRVLKARGLMKESRSITSLFHTMSEANFFNRYIAHHHKEFPELLDIYRGSNVISKST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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