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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000655`

染色体: Chr06 坐标: 5760720-5762056 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000655`
名称	SmilChr06G000655
描述	uncharacterized SmilChr06G000655
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5760720 - 5762056 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990403`
GeneID	`130990403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990403`
原始查询	`SmilChr06G000655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684]; symbol=AT5G07900; hit=AT5G07900; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G07900` (AT5G07900) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830684] identity=38.3; qcov=0.887; evalue=8.06e-46; confidence=medium
Rice	`Os05g0413000` - identity=29.1; qcov=0.854; evalue=2.34e-29; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057770624.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057770624.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770624.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770624.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5760725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr6:5760741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D6
`Chr6:5760751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr6:5760847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:5760874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C4
`Chr6:5760927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:5760950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr6:5760970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:5760978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C69
`Chr6:5760983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B128,C69
`Chr6:5760983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C69
`Chr6:5760999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B128,C48,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770624.1

274 aa

137

274

mTERF

PF02536 mTERF 52-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770624.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	52	242	8.7e-21	74.9	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914641.1
ATGGGGTGTAGGGAGCTGAGGTTAGATTTCAGCCGCGGCGACGCCAGTTTCACCATCAGTTACCTCACAAATTCATGTGGATTGTCGTTGAAAGACGCCTTCTTCGTATCCGCGAAATTGTGCATCAAATCGCGAGAGAATTCAGATACAATATTGCAGCTACTCAAAAGGTACGGATTCACAAATGCTCAGATCTCCAGGCTCGTCAGGAAATGGCCGGGCGTTCTTCAATCCAGAGCCGACAAAACCATATCACCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990403
ATGGGGTGTAGGGAGCTGAGGTTAGATTTCAGCCGCGGCGACGCCAGTTTCACCATCAGTTACCTCACAAATTCATGTGGATTGTCGTTGAAAGACGCCTTCTTCGTATCCGCGAAATTGTGCATCAAATCGCGAGAGAATTCAGATACAATATTGCAGCTACTCAAAAGGTACGGATTCACAAATGCTCAGATCTCCAGGCTCGTCAGGAAATGGCCGGGCGTTCTTCAATCCAGAGCCGACAAAACCATATCACCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770624.1
MGCRELRLDFSRGDASFTISYLTNSCGLSLKDAFFVSAKLCIKSRENSDTILQLLKRYGFTNAQISRLVRKWPGVLQSRADKTISPKLEFFCSIGVPPAALPQKLSEYPFLMRRSFDNYFTPWYKYLKSNVQSDKNVVAVFLSSPRAFTHGWPERIHSNIGILRERGVPESSITLLIVNKPSMMILKQDKFGACVDWAAELGLAPSKVVFVRTLQVFGRLSESTVKHKMGVYRRCGWSECDLNVKCCIFKNTYYSLCPRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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