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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000660`

染色体: Chr06 坐标: 5805804-5806471 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000660`
名称	SmilChr06G000660
描述	uncharacterized SmilChr06G000660
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5805804 - 5806471 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988205`
GeneID	`130988205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988205`
原始查询	`SmilChr06G000660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041]; symbol=AT4G03200; hit=AT4G03200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041]; symbol=AT4G03200; hit=AT4G03200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G03200` (AT4G03200) catalytics [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828041] identity=70; qcov=0.598; evalue=7.37e-25; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF03190 (Thioredox_DsbH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057767976.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767976.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767976.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057767976.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057767976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5805872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:5806153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B29,B61,C74
`Chr6:5806271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:5806311`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A11,A16,B128,B137,B138,B16,B19,B32,B52,C13,C29,C43,C49,C66,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767976.1

117 aa

117

Thioredox_DsbH

PF03190 Thioredox_DsbH 70-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767976.1`	Pfam	`PF03190`	Thioredox_DsbH	Family	70	105	3.7e-13	50.5	Protein of unknown function, DUF255

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911993.1
TTCTCCAACTGTCCATTTTTCTGCCACGTACAACATCAGCTTCGCCACCACTACCAAATGGCAATTGTCAAACTCTCTCCCTAATTTTCTTTCGGCAACTCTATAAATTCTCTACATTTTCGATCAATTCCTTTTCTTTTCTTCACTAATATGCTCAAAAGACTTCTCATTTCTCGCCGCTTCATCTGTCATTACAAACCCACCTATAATTCGGCGAAGAAACCCGACAATTCGGAATCCTTTCCATTTTCTTGGCCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988205
ATGCTCAAAAGACTTCTCATTTCTCGCCGCTTCATCTGTCATTACAAACCCACCTATAATTCGGCGAAGAAACCCGACAATTCGGAATCCTTTCCATTTTCTTGGCCGTTATCGGTGGTTTCTTGCCGGCCCATCAACTTTTCTAGAGTTCTGGCCATGGCGGATGGCGGGTCCCCTAAAACCGCGTCGTCGAAGCCCCAGAAGCACACTAACCGGCTTGCAGCGGAGCACAGTCCTTACCTTCTTCAACATGCCCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767976.1
MLKRLLISRRFICHYKPTYNSAKKPDNSESFPFSWPLSVVSCRPINFSRVLAMADGGSPKTASSKPQKHTNRLAAEHSPYLLQHAHNPVDWYPWGEEAFAEASVEKSGNSRITIIDY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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