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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000672`

染色体: Chr06 坐标: 5910202-5914959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000672`
名称	SmilChr06G000672
描述	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	5910202 - 5914959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988214`
GeneID	`130988214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988214`
原始查询	`SmilChr06G000672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump-like
产物	pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump-like
Arabidopsis	`AT1G15690` (AVP1) Inorganic H pyrophosphatase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838138] identity=87.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0644200` (OVP1) - identity=85.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004427 (inorganic diphosphate phosphatase activity); GO:0009678 (diphosphate hydrolysis-driven proton transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF03030 (H_PPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057767982.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057767982.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057767982.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767982.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:5910438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr6:5910454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:5910472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr6:5910550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr6:5910738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr6:5910891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:5910953`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr6:5910953`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr6:5911063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr6:5911139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr6:5911572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B1,C84
`Chr6:5911578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B13,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767982.1

763 aa

382

763

H_PPase

PF03030 H_PPase 21-748 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767982.1`	Pfam	`PF03030`	H_PPase	Family	21	748	5.6e-256	852.0	Inorganic H+ pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911999.1
AAACCTTCAATTGCAGAAACAGTAGAAGAAACTCGAGAGAGAGAGAGAGGAAATTAGGAAAATTGGGTTTAACTTTAACCACCTGCCAAAATTTCGGCACCAAAAGGCGCGTAGGACAAAGCCCTACTCCCCAACCATTTTGATTGTGATCACAGCTGTTGAACTTGTTCTTCTTCTCAATCAGTTACGGACCGAAAGCAATGGGCGAGGCGACGCTGCTCTCGGATATCGGAACCGAGATTCTCATCCCTATATGCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988214
ATGGGCGAGGCGACGCTGCTCTCGGATATCGGAACCGAGATTCTCATCCCTATATGCGCCGTCGTCGGTATAGCCTTCGCCGTCGTGCAGTGGATGCTCGTCTCTAAGGTCAAGCTCTCCACCGCCGCCTCACACGACGCCAAAAATGGAATCACGGATCCGCTCGTTGAGGAAGAGGACGGCGTCGCCGACCACTCCGTCGTCCGCAAGTGTGCCGACATCCAGGCCGCCATTTCCGAAGGTGCAACATCATTTCTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767982.1
MGEATLLSDIGTEILIPICAVVGIAFAVVQWMLVSKVKLSTAASHDAKNGITDPLVEEEDGVADHSVVRKCADIQAAISEGATSFLLTEYQYVGIFMIAFAILIFLFLGSVEGFSTKSQPCTYDETKLCKPALATAVFSTIAFILGAITSVVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFIIAFRSGAVMGFLLAANGLLVLYIAINLFKLYYGDDWEGLFESITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVGKVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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