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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000691`

染色体: Chr06 坐标: 6123519-6124989 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000691`
名称	SmilChr06G000691
描述	uncharacterized SmilChr06G000691
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6123519 - 6124989 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988238`
GeneID	`130988238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988238`
原始查询	`SmilChr06G000691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708]; symbol=AT1G12244; hit=AT1G12244; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708]; symbol=AT1G12244; hit=AT1G12244; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12244` (AT1G12244) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708] identity=59.3; qcov=1.01; evalue=3.11e-79; confidence=high
Rice	`Os10g0555200` - identity=65.3; qcov=0.742; evalue=4.59e-70; confidence=high
GO	GO:0000967 (rRNA 5'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF03652 (RuvX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768014.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057768014.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768014.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768014.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6123606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B80
`Chr6:6123670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A23,B24,B33,C12,C21
`Chr6:6123670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B24,B33,C12,C21
`Chr6:6124044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:6124344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B4,B65,C37,C74
`Chr6:6124512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr6:6124664`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr6:6124664`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr6:6124665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B28,B86,C82,C85
`Chr6:6124812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768014.1

229 aa

114

229

RuvX

PF03652 RuvX 62-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768014.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	62	191	1.4e-24	87.7	Holliday junction resolvase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912031.1
GTAGTTCCACAACAATAATACTATTTGTATTCAAAAAGGTATGGCCTACATCATACTTCCTTATAGTTATAAACCCCATTCTCCTTCTTATCTGCCTGCTCTTCAACTTTAAAAAATGGCGATTCAATTCATTGCTCCAAAACCCCTAAACCCTCTTCTTCCTCTTCACATTCAATGCAGAAACTCAATTTCTCCGTGCAGAGGAGCGCAATTGTCGGAATCAGTGGCGTGGGAGGAGCAAATTCCCCCAAACGCTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988238
ATGGCGATTCAATTCATTGCTCCAAAACCCCTAAACCCTCTTCTTCCTCTTCACATTCAATGCAGAAACTCAATTTCTCCGTGCAGAGGAGCGCAATTGTCGGAATCAGTGGCGTGGGAGGAGCAAATTCCCCCAAACGCTATCCGCCGGAAGCGTGATCCGTCGTGGCGCGGCGGGTTTAGCCTAGGGGTAGATTTGGGATTGTCGCGGACAGGCGTTGCCATTAGCAAAGGCTTCACTGTTCGCCCCTTAACGGTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768014.1
MAIQFIAPKPLNPLLPLHIQCRNSISPCRGAQLSESVAWEEQIPPNAIRRKRDPSWRGGFSLGVDLGLSRTGVAISKGFTVRPLTVLELRGQKLELRLLDLAEKQEVDEFIIGLPKSSEGKETEQSNKVRSVAGRFAARAAERGWRVYLQDEHGTSSEALEHMIATGVSKSVRQGKLDAYAAMKVLERYFSESGKGIEAVVPKQPHLQNKLREGPPKDIDFYSPTTDTY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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