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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000693`

染色体: Chr06 坐标: 6134821-6136151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000693`
名称	SmilChr06G000693
描述	calmodulin-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6134821 - 6136151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988240`
GeneID	`130988240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988240`
原始查询	`SmilChr06G000693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-like protein 3
产物	calmodulin-like protein 3
Arabidopsis	`AT3G59440` (AT3G59440) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825113] identity=42.9; qcov=0.968; evalue=5.22e-44; confidence=medium
Rice	`Os04g0492800` (OsCML22) - identity=48.4; qcov=0.714; evalue=4.14e-39; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057768016.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057768016.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768016.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768016.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768016.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6135308`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr6:6135308`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr6:6135315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B37,B74
`Chr6:6135490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr6:6135522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B3,B47,B53,B58
`Chr6:6135710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6135777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B28,B86,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768016.1

217 aa

108

217

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_1

EF-hand_8

EF-hand_5

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF13405 EF-hand_6 61-89 aa PF13499 EF-hand_7 61-121 aa PF13202 EF-hand_5 62-83 aa PF00036 EF-hand_1 62-86 aa PF13833 EF-hand_8 73-122 aa PF13202 EF-hand_5 102-117 aa PF00036 EF-hand_1 143-170 aa PF13405 EF-hand_6 143-172 aa PF13499 EF-hand_7 143-207 aa PF13202 EF-hand_5 144-166 aa PF13833 EF-hand_8 155-208 aa PF00036 EF-hand_1 181-208 aa PF13202 EF-hand_5 184-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	61	89	6e-23	79.0	EF-hand domain
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	61	121	3e-32	111.5	EF-hand domain pair
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	62	83	9.4e-19	66.7	EF hand
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	62	86	4.8e-27	92.2	EF hand domain
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	73	122	2.8e-11	43.7	EF-hand domain pair
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	102	117	9.4e-19	66.7	EF hand
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	143	170	4.8e-27	92.2	EF hand domain
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	143	172	6e-23	79.0	EF-hand domain
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	143	207	3e-32	111.5	EF-hand domain pair
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	144	166	9.4e-19	66.7	EF hand
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	155	208	2.8e-11	43.7	EF-hand domain pair
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	181	208	4.8e-27	92.2	EF hand domain
`XP_057768016.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	184	206	9.4e-19	66.7	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912033.1
GAAATTGAATGGAACAAGAAGAACATAGAAGAAAACCAAAAAGAAGTAAAGTGAAAGCGATACAACCAATATATAGAGGCATTGAATTTCCAGTTCCACCAAAACTAAAGATTTTGTTTTATATTTTAATTTACAGTTACGACAGTTTCACGCGGTTTGTGGGATCAACAAACGCCTCCATCATATTTATTCCCTCCATTAATCAACAACTCCCATTTTCTCCAAAATCTGTGTTGGTCTTGTTGTTGTTGTGAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988240
ATGATTACAGTCCTGCTCTACTCTCTCCTCTTCGTCTTCGCCCTCATCTATACCTTAATCTCTCCAACCAAGAAGTTTCTCGCGCCATGGCTCGAATCGTTCCGCGATCGCAAAACCCTACCGCCGCAGGATTCGATCAAGCCCGCCGCCGCCTCCGCCCCGCCGGCTGCTATCGGCGGGCTGAGAGGCGTGTTCGCGACGTTCGACAAGAACAACGACGGATTCATCACGAAGCAGGAGCTGAGGGAGTCGCTCCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768016.1
MITVLLYSLLFVFALIYTLISPTKKFLAPWLESFRDRKTLPPQDSIKPAAASAPPAAIGGLRGVFATFDKNNDGFITKQELRESLQNIGILAGEKDVEDMVEKVDFNGDGLIDFDEFCKLYESMGGAAEVGGGGDGDGDGDGDLREAFDVFDGNKDGRITVEELGLVLSSLGFSEGKKIEDCKEMIRKVDVDGDGMVDFDEFKKMMRDGLGRLIAVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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