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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000699`

染色体: Chr06 坐标: 6216183-6219987 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000699`
名称	SmilChr06G000699
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 6
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6216183 - 6219987 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988246`
GeneID	`130988246`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988246`
原始查询	`SmilChr06G000699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 6
产物	probable galactinol--sucrose galactosyltransferase 6
Arabidopsis	`AT5G20250` (DIN10) Raffinose synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832147] identity=68.7; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0172800` - identity=65.5; qcov=0.844; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05691 (Raffinose_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988246

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768021.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057768021.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768021.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768021.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6216559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6216661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C17
`Chr6:6216858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6216876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C17
`Chr6:6217547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:6218341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6218390`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B82
`Chr6:6218390`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B82
`Chr6:6218413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:6218653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B24,B40,D11
`Chr6:6218724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B12,B84
`Chr6:6218817`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768021.1

848 aa

424

848

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 75-830 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768021.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	75	830	0	1075.3	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912038.1
TCCATGTAACACATTGGATTAGTCAATTGAAACTTATTCTAATATAAAAAAAAGGTGTTCATCAACACAATCTAATACTACTATGCTACAAGATAAATACAAAATAGAATCATATTCTTGGCAAAATAAACTCCATATACCAAAATTCTAGAACTAATCCAATGTGTTACATGCGGATACTTTTTCAAAATTTCGATAATAACACTTCAAACAATAGCAATTAACACCAAAACGAAATTAAAAATAGAATTTTCTCAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988246
ATGGTGGTTTCTTCCTTCTCAATTCCATTTCCCAGTTCCACAACACCTATAAATACCCCCTTCCTCAACTCCATTGCAACATTCACTTCTTCCTCTTCTCTTACACGCTTACTTCACACCAAAAACACACCTCTCTTCAACCTATCATCATCGTCTTCTTCACACAATCGTATTCTCGCTTACAGAGCTAGTGAGGAATCAGCGATGACTATTAAACCAGCTGTCCGGATCGCCGAGAGGAAGCTCGTGGTGAAGGACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768021.1
MVVSSFSIPFPSSTTPINTPFLNSIATFTSSSSLTRLLHTKNTPLFNLSSSSSSHNRILAYRASEESAMTIKPAVRIAERKLVVKDRTILANVPENVIATSGAAAGPVEGVFSGAAFDQERCSHVVSLGTLRDVRFLACFRFKLWWMAQKMGDKGRDIPLETQFLLLETKEGSHLEADEDNDDNKIVYTVFLPLIEGPFKACLQGNAADELELCLESGDFDTVGSTFTHSVYISCGTDPFAAVHDAIKAVKLHLGTFRLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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