当前解析结果
SmilChr06G000702| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000702 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000702 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000702 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 6269552 - 6271191 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988251 |
|---|---|
| GeneID | 130988251 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988251 |
| 原始查询 | SmilChr06G000702 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988251 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057768029.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.60000 | XP_057768029.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768029.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768029.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768029.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:6269616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,C49 |
Chr6:6269618 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B25,C87 |
Chr6:6269640 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A2,A20,A24,B12,B124,B2,B45,B51,B65,B69,B72,B82,C19,C41,C42,C45,C71,D11,D4,D5 |
Chr6:6269641 |
T |
TAC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 197 | A1,A10,A11,A13,A14,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B53,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C52,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9 |
Chr6:6269653 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B109,B112,B115,B58,B86,B93,B99,C18,C34,C36,C44 |
Chr6:6269655 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | B109,B112,B115,B58,B86,B93,B99,C18,C34,C36,C44 |
Chr6:6269663 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A13,B121,B15,B19,C23,C84,D1,D7 |
Chr6:6269664 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A24,B101,B110,B119,B16,B4,B42,B50,B57,C35,C37,C39,C46,C56,C59,C61,C66,C72,C74 |
Chr6:6269692 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B72,C19,C41,C42 |
Chr6:6269720 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B136,B46 |
Chr6:6269720 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B136,B46 |
Chr6:6269722 |
AGC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B136,B46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。