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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000705`

染色体: Chr06 坐标: 6298107-6299300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000705`
名称	SmilChr06G000705
描述	36.4 kDa proline-rich protein-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6298107 - 6299300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988254`
GeneID	`130988254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988254`
原始查询	`SmilChr06G000705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	36.4 kDa proline-rich protein-like
产物	36.4 kDa proline-rich protein-like
Arabidopsis	`AT2G10940` (AT2G10940) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815558] identity=82.3; qcov=0.45; evalue=2.43e-44; confidence=low
Rice	`Os06g0643500` - identity=74.1; qcov=0.45; evalue=6.7e-36; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2); PF14547 (Hydrophob_seed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057768039.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057768039.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768039.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768039.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768039.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6298754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:6298840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:6298895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr6:6298983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A3,B104,D10
`Chr6:6299001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B1,B71,C62
`Chr6:6299042`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A3,A5,A7,B111,B93,B99,C34,C43,C49,C66,D10
`Chr6:6299170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768039.1

189 aa

189

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

Hydrophob_seed

PF14368 LTP_2 94-187 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 106-187 aa PF14547 Hydrophob_seed 106-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768039.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	94	187	4.8e-06	27.3	Probable lipid transfer
`XP_057768039.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	106	187	2.1e-11	44.6	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057768039.1`	Pfam	`PF14547`	Hydrophob_seed	Domain	106	188	5.5e-28	97.8	Hydrophobic seed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912056.1
TCTCTTTTTCACGTCATGGATTCCTCCAAGATTTCCGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCCTCTCCTCCGCCGCCCCCATCCTCGACCCCCAATGCGGCTACTGCTCCCATCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCAAACCCCCCACCGTAAAACCCCCCATCCACCTACCCCCCACCGTAAAACCTCCCATCAACCTACCCCCCATCCACCTACCCCCCACCGTAAAACCCCCCATCAACCTACCCCCCGCCGTGCCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988254
ATGGATTCCTCCAAGATTTCCGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTCCCTCTCCTCCGCCGCCCCCATCCTCGACCCCCAATGCGGCTACTGCTCCCATCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCAAACCCCCCACCGTAAAACCCCCCATCCACCTACCCCCCACCGTAAAACCTCCCATCAACCTACCCCCCATCCACCTACCCCCCACCGTAAAACCCCCCATCAACCTACCCCCCGCCGTGCCCGTGCCCGTGCCCGTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768039.1
MDSSKISALLLLLLLSLSSAAPILDPQCGYCSHPRPRPRPKPPTVKPPIHLPPTVKPPINLPPIHLPPTVKPPINLPPAVPVPVPVPMPPVKGKGCPPPAPSPPSCPIDTLKLGACVDLLGGLIHIGLGDPAANECCPLIAGLVEIEAAVCLCTTLKIKALNLNLYIPLALQLLLTCGKTPPPGYTCSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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