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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000715`

染色体: Chr06 坐标: 6506773-6510301 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000715`
名称	SmilChr06G000715
描述	uncharacterized SmilChr06G000715
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6506773 - 6510301 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988266`
GeneID	`130988266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988266`
原始查询	`SmilChr06G000715`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377]; symbol=AT2G47640; hit=AT2G47640; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377]; symbol=AT2G47640; hit=AT2G47640; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G47640` (AT2G47640) Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819377] identity=91.7; qcov=1; evalue=2.86e-70; confidence=high
Rice	`Os05g0314100` - identity=92.2; qcov=0.954; evalue=2.02e-66; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768052.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768053.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768052.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768052.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6508571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C11,C69
`Chr6:6508574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:6508592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B136,C17,D11
`Chr6:6508862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B59
`Chr6:6508894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768052.1

112 aa

112

LSM

PF01423 LSM 28-70 aa

XP_057768053.1

108 aa

108

LSM

PF01423 LSM 28-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768052.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	28	70	7e-12	45.6	LSM domain
`XP_057768053.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	28	103	5.1e-18	65.2	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090035.1
AAATTTAATTCAGCCCATCCACACTTTTCAACCCTAAAATACAGCTTAGATACTCATCTCCTCTAAAATTAGGGTTCAGCGCCGCTTCTTCTCTCTCATTTCTTCTCCCATCCGTGCTCTCCCTTGTCTTCTCTCTCCCTCTGCCGACTTTCTTCCACCTGCCGGCGAGAAGCTCAAACGTTCTCTCTATCGTCTTCTCTCTCCCTCTGCCGGAGAAAAACCTGCAACCGTATCGCGGCTCGGTCCGAAAACCCTTAGAT...

XM_057912070.1
AAATTTAATTCAGCCCATCCACACTTTTCAACCCTAAAATACAGCTTAGATACTCATCTCCTCTAAAATTAGGGTTCAGCGCCGCTTCTTCTCTCTCATTTCTTCTCCCATCCGTGCTCTCCCTTGTCTTCTCTCTCCCTCTGCCGACTTTCTTCCACCTGCCGGCGAGAAGCTCAAACGTTCTCTCTATCGTCTTCTCTCTCCCTCTGCCGGAGAAAAACCTGCAACCGTATCGCGGCTCGGTCCGAAAACCCTTAGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988266
ATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCGAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATGTTGAGTGTTAAGAATAACACACAGGTGCTCATCAACTGCCGTAACAACAAAAAGCTTCTGGGCCATGTGAGGGCTTTTGATCGCCACTGCAACATGGTCCTCGAAAATGTCCGGGAGATGTGGACTGAGGTGCCTAAGACTGGTAAAGGCAAAAAGAAAGCTCTTCCAGTTAACAAGGA...

LOC130988266
ATGAGTCGGCCAATGGAAGAAGATGCTCCGGCGAAGAATGAGGAGGAGGAGTTCAACACTGGTCCACTTTCTGTCTTGATGTTGAGTGTTAAGAATAACACACAGGTGCTCATCAACTGCCGTAACAACAAAAAGCTTCTGGGCCATGTGAGGGCTTTTGATCGCCACTGCAACATGGTCCTCGAAAATGTCCGGGAGATGTGGACTGAGGTTTGTTTATATCTAGGACTGCTTCCATATGTCTATATATTCAGTATCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768052.1
MSRPMEEDAPAKNEEEEFNTGPLSVLMLSVKNNTQVLINCRNNKKLLGHVRAFDRHCNMVLENVREMWTEVCLYLGLLPYVYIFSIKLLTYSLCYWDMFLIPISNCIHYIGA

XP_057768053.1
MSRPMEEDAPAKNEEEEFNTGPLSVLMLSVKNNTQVLINCRNNKKLLGHVRAFDRHCNMVLENVREMWTEVPKTGKGKKKALPVNKDRFISKMFLRGDSVIIVLRNPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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