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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000726`

染色体: Chr06 坐标: 6689336-6691770 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000726`
名称	SmilChr06G000726
描述	uncharacterized SmilChr06G000726
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6689336 - 6691770 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988277`
GeneID	`130988277`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988277`
原始查询	`SmilChr06G000726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402]; symbol=AT4G08430; hit=AT4G08430; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402]; symbol=AT4G08430; hit=AT4G08430; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G08430` (AT4G08430) Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826402] identity=24.8; qcov=0.352; evalue=9.35e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988277

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768065.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768065.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768065.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768065.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6689484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B99
`Chr6:6689518`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B107
`Chr6:6689518`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B107
`Chr6:6689578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr6:6689879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B20,B49,B75,B94
`Chr6:6689882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B47,B67,C73
`Chr6:6689897`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B112,B20,B94
`Chr6:6689897`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B112,B20,B94
`Chr6:6689901`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B112,B20,B94
`Chr6:6689901`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B112,B20,B94
`Chr6:6689902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:6689928`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A19,A3,A5,B112,B114,B119,B120,B121,B125,B19,B20,B29,B49,B62,B80,B82,B85,B94,C13,C16,C25,C36,C40,C56,C61,C65,C67,C68,C7,C73,C79,C8,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768065.1

562 aa

281

562

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 420-531 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768065.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	420	531	7.1e-11	43.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912082.1
TGGGGTCTAGCTTCATATCAGTATCTTGTTAGTTCGACGCATCGGTTGAAGCGTGAGTTGGCATCCGTTGTGAAAGATTTGCACACTAACTCAATGGTCGCCTATGGATTTGTTTACGCGCTACAGTGTTGGGCATATGAAGTTATGCCGGCTCTTGGAACATATTGTGCCTCGTTGAATGCAGCACGTCTCACGAGTTTTCCTCGAATAATGAAATGGATTGTTACTCGAAGCTTGATTTTGGAAGATGATGGGCTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988277
ATGGTCGCCTATGGATTTGTTTACGCGCTACAGTGTTGGGCATATGAAGTTATGCCGGCTCTTGGAACATATTGTGCCTCGTTGAATGCAGCACGTCTCACGAGTTTTCCTCGAATAATGAAATGGATTGTTACTCGAAGCTTGATTTTGGAAGATGATGGGCTAAGGAAATTTTTTTTGGCTGAGCATGGATGTGAACCTGTACGCATGTCTTTATCCTCTAGTGAAATTAAGAATTTGGTGCAGCTCGGCATCACCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768065.1
MVAYGFVYALQCWAYEVMPALGTYCASLNAARLTSFPRIMKWIVTRSLILEDDGLRKFFLAEHGCEPVRMSLSSSEIKNLVQLGITPSMAVASPSPFVEKTKNVGRKLVFDSGERTKSSSKKQNSKRKSLRLGSSPCRNTSAKSVDLEDCEIIEPHELKRLVPKLKKSRGGQIHVSENTPRSDRHSNTHLVTPEGSSLIVDAKLNDITNMFLSLKGQIKCLEEYIELKLKNFEVMIKKCGGGICCSCEQKVFKNVMDDVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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