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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000741`

染色体: Chr06 坐标: 6892930-6894677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000741`
名称	SmilChr06G000741
描述	uncharacterized SmilChr06G000741
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6892930 - 6894677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990416`
GeneID	`130990416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990416`
原始查询	`SmilChr06G000741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=38.6; qcov=0.346; evalue=5.2e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770634.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770634.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770634.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770634.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6892984`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A14,A4,A8,B113,B17,B18,B2,B27,B32,B35,B44,B48,B6,B70,B71,B72,B87,C18,C26,C3,C38,C47,C5,C54,C56,C7,C77,C84,C9,D8,D9
`Chr6:6892989`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,A3,B106,B135,C54
`Chr6:6892989`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A2,A3,B106,B135,C54
`Chr6:6892998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:6893019`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B3,D7
`Chr6:6893019`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B3,D7
`Chr6:6893026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B48
`Chr6:6893036`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	92	A11,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A6,A7,B107,B109,B111,B114,B119,B120,B122,B123,B124,B127,B131,B134,B135,B137,B139,B20,B24,B25,B26,B29,B31,B40,B44,B48,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B67,B70,B73,B75,B76,B79,B8,B80,B85,B88,B90,B92,B94,B96,B97,C1,C12,C15,C21,C24,C29,C31,C33,C34,C35,C4,C42,C43,C46,C50,C52,C53,C57,C58,C60,C62,C63,C69,C74,C79,C8,C81,C83,C85,C9,D1,D10,D2,D6
`Chr6:6893044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr6:6893072`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B27,B35,B71,B72,C38,C5
`Chr6:6893132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B11
`Chr6:6893163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B102,B104,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770634.1

508 aa

254

508

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 120-176 aa PF13952 DUF4216 354-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770634.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	120	176	4.1e-17	62.8	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057770634.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	354	426	2.2e-18	67.3	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914651.1
ATGAATGCTAGAGGCAAAACAAAAGACACTAACAAATCCCGCGAAGAATTAAATCTTTTTTGTTGCAGGCCTGAATTGCAAGGCAACAGTGCTACTGGTAAGTATCCAAAGGCTGTTTATATGCTCGATAATGATGACAAAAGTATTATTTTGAAGTGGATTGAAGAACTCCGATTTCCTGATGAATATGTTTCAAATTTGGGGAGATGTGTGAATTTGAGCACTCTGCAAATGTTTGGAATAAAGAGCCATGATTGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990416
ATGAATGCTAGAGGCAAAACAAAAGACACTAACAAATCCCGCGAAGAATTAAATCTTTTTTGTTGCAGGCCTGAATTGCAAGGCAACAGTGCTACTGGTAAGTATCCAAAGGCTGTTTATATGCTCGATAATGATGACAAAAGTATTATTTTGAAGTGGATTGAAGAACTCCGATTTCCTGATGAATATGTTTCAAATTTGGGGAGATGTGTGAATTTGAGCACTCTGCAAATGTTTGGAATAAAGAGCCATGATTGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770634.1
MNARGKTKDTNKSREELNLFCCRPELQGNSATGKYPKAVYMLDNDDKSIILKWIEELRFPDEYVSNLGRCVNLSTLQMFGIKSHDCHVMMQRILPIAFKELLPINVWKAITDLCLYFKELTSPNLQVDNLRQMHQNIPVILCKLERIFPPSFFDSMEHLPIHLAYEALLAGPDHIQTIQRNIPRNLVGASSSGIEDHPHMLTIFKNIGRVFGKNSSRFLQKEEYDAAHLYVLNNCPEVTNTYTGLFFDEIKYKFPRITAN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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