Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000743`

染色体: Chr06 坐标: 6900070-6901407 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000743`
名称	SmilChr06G000743
描述	uncharacterized SmilChr06G000743
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	6900070 - 6901407 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988292`
GeneID	`130988292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988292`
原始查询	`SmilChr06G000743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820819]; symbol=AT3G15760; hit=AT3G15760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cytochrome P450 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820819]; symbol=AT3G15760; hit=AT3G15760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G15760` (AT3G15760) cytochrome P450 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820819] identity=43.7; qcov=1.04; evalue=2.93e-16; confidence=low
Rice	`Os06g0604600` - identity=36.3; qcov=0.869; evalue=6.26e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057768086.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057768086.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768086.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768086.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:6901134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,C53,C61,D3
`Chr6:6901152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr6:6901174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912103.1
CTGCATCAGCCCAACTGCCACATTAAATAAACAAACCATTTTCCCTCTTCTCCCTCTCATTCCCATCACCAACTCTCTCTCTCTCCCCTTGTCTTTCTCTCTCTACACACAAACACAGAGGAACAGAATTGACAGATCGTCAGCAATCATGTCTTCGATTCTGTCATCACAGAGCGTGGTGTTGGCCACCGCCATGGCAGTTTCCGGCACAGTGATTCTGCTCGCCGCTCGCCGCCTCCAAAAGCCGCCGTCGACGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988292
ATGTCTTCGATTCTGTCATCACAGAGCGTGGTGTTGGCCACCGCCATGGCAGTTTCCGGCACAGTGATTCTGCTCGCCGCTCGCCGCCTCCAAAAGCCGCCGTCGACGACTGCCCATTTTCCACTGCTACCATCTTGCATCATTCCTTCCTCAGATGAAGGGAAGAAAAGGAAGAAGAAGAAGAAGGTGCACTTTGCAGAAGATGTGGTGGACCCAATTGGGAATAGTGAAGAATACCGGAAATCACATAAGGCTAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768086.1
MSSILSSQSVVLATAMAVSGTVILLAARRLQKPPSTTAHFPLLPSCIIPSSDEGKKRKKKKKVHFAEDVVDPIGNSEEYRKSHKANLNKYSNSTTLNKGRKIQEMPANRLALYNGMLRDRVLHKVAYACS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器