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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000764`

染色体: Chr06 坐标: 7109058-7120338 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000764`
名称	SmilChr06G000764
描述	fe-S cluster assembly factor HCF101, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7109058 - 7120338 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988310`
GeneID	`130988310`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988310`
原始查询	`SmilChr06G000764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fe-S cluster assembly factor HCF101, chloroplastic
产物	fe-S cluster assembly factor HCF101%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G24430` (HCF101) ATP binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822033] identity=87.1; qcov=0.861; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0719700` (OsISC36) - identity=86; qcov=0.188; evalue=7.9e-59; confidence=weak
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0140663 (ATP-dependent FeS chaperone activity)
KEGG	-
Pfam	PF01656 (CbiA); PF01883 (FeS_assembly_P); PF06155 (GBBH-like_N); PF09140 (MipZ); PF10609 (ParA); PF13614 (AAA_31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988310

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768106.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057768106.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057768106.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768106.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768106.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7109755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr6:7118205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr6:7119313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:7119938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768106.1

531 aa

266

531

FeS_assembly_P

ParA

AAA_31

MipZ

CbiA

GBBH-like_N

PF01883 FeS_assembly_P 82-155 aa PF10609 ParA 177-413 aa PF13614 AAA_31 179-298 aa PF09140 MipZ 180-326 aa PF01656 CbiA 181-326 aa PF06155 GBBH-like_N 449-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF01883`	FeS_assembly_P	Domain	82	155	1.9e-20	73.6	Iron-sulfur cluster assembly protein
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF10609`	ParA	Family	177	413	2.9e-81	273.3	NUBPL iron-transfer P-loop NTPase
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF13614`	AAA_31	Domain	179	298	3.8e-09	37.4	AAA domain
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF09140`	MipZ	Domain	180	326	9.5e-07	29.1	ATPase MipZ
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF01656`	CbiA	Domain	181	326	1e-09	39.1	CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain
`XP_057768106.1`	Pfam	`PF06155`	GBBH-like_N	Domain	449	510	5.5e-09	37.3	Gamma-butyrobetaine hydroxylase-like, N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912123.1
TGACGTTCCACTAGATTCTGCCAATAGAGATTACACGACCATCACCCACCCCCACCCCCAGCATGGATGGAAACGTGAGGCCTCAATTCTCTGCACAAAACACACCTTCTGCTTCTCTTTCTCTTTCACACACTCACACACACCGCGGAAGCAAAAATGCAGCTGCTTCAGGCTCCTCTGGCATTCCGCTGCTCCGTATCGCAATCAAACGCCAGAGCCGCGCATGTCGCCGGAAAGTCATTTTCCGAACCAATTTTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988310
ATGCAGCTGCTTCAGGCTCCTCTGGCATTCCGCTGCTCCGTATCGCAATCAAACGCCAGAGCCGCGCATGTCGCCGGAAAGTCATTTTCCGAACCAATTTTTGCTGCCGCTGCTGCTTCATTTCTATCTCCTAGGCATTTTAAGCCTGCCTTCATTTCTTATGGCGATGCACTATATAGCTCAATTTCAGCTAAAGCTGCTTCATCCCCAGCTTCCGTTACTGAAGTATCAAGTCAAACAGCTGAGGCTGATGTCCTAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768106.1
MQLLQAPLAFRCSVSQSNARAAHVAGKSFSEPIFAAAAASFLSPRHFKPAFISYGDALYSSISAKAASSPASVTEVSSQTAEADVLKALSQIIDPDFGTDIVSCGFVKDLDVDKESGKVSFRLELTTPACPVKDMFEQKANEVVATLPWVEKVEVTMSAQPARPLYASQLPAGLQTISNIVAVSSCKGGVGKSTVAVNLAYTLAGMGARVGIFDADVYGPSLPTMVSPENRLLEMNPEKRTIIPTEYMGVKLVSFGFAGQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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