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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000768`

染色体: Chr06 坐标: 7160755-7162823 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000768`
名称	SmilChr06G000768
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7160755 - 7162823 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988315`
GeneID	`130988315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988315`
原始查询	`SmilChr06G000768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 8
Arabidopsis	`AT3G24330` (AT3G24330) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822022] identity=63.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0792800` (OSJNBb0060J21.19) - identity=55.5; qcov=0.908; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057768112.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057768112.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768112.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768112.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768112.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7161102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:7161112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr6:7161232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B76
`Chr6:7161279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B57
`Chr6:7161328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:7161367`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	96	A1,A16,A18,A24,A5,A7,A9,B101,B103,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B115,B12,B123,B129,B13,B130,B132,B134,B139,B16,B2,B20,B25,B28,B3,B31,B32,B34,B37,B41,B42,B43,B44,B49,B50,B55,B65,B66,B68,B69,B70,B73,B75,B79,B8,B80,B82,B86,B89,B9,B93,B95,B98,B99,C13,C15,C17,C2,C20,C25,C27,C28,C3,C31,C34,C35,C36,C4,C46,C5,C51,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C74,C77,C78,C81,C83,C85,C9,D10,D2,D5,D6,D9
`Chr6:7161451`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B90
`Chr6:7161451`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B90
`Chr6:7161561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B74
`Chr6:7161561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr6:7161637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr6:7161683`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768112.1

502 aa

251

502

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 39-359 aa PF07983 X8 382-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768112.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	39	359	1.5e-69	235.7	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057768112.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	382	451	1.6e-16	61.4	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912129.1
TGGCTTAACGCATCAGAGATTAAATCTATGCATGGGATTGTCATGTTCAACTTTACACTCTATTATCATTATTATTCAATTCAAACCATCACACACTTTTTAATTTCTCAGTGGGTCTCCTTGCAATTGCTGTTGCATGCATAACTGAATAACAGAATTAAGAAACGAATCTGTATATTCAATTCTCCCATCACATTTATCCACTCTTTTCATTCTAATCCAATTTCATGACCATCTTCTCCAACGTAAAAACATTAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988315
ATGGAGCGAAGACGGTCAAATGATCATCAAAATGTGGTGATTTTGTTGGGTGTGATGACGATGTTGACGGCGACATCATCATCATCATCATCATCATCAGCAAGCAGCAGTAGCGTGGGAGTGAACTGGGGCACAATGGCAACACACCAGTTGTCTGCTGCGAGCGTTGTTGATATGCTGAAAGACAACGGTTTCGACAAGGTGAAGCTCTTCGACGCCGACGAGACCATCTTGGACGCATTGTCCGGCACCGATATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768112.1
MERRRSNDHQNVVILLGVMTMLTATSSSSSSSSASSSSVGVNWGTMATHQLSAASVVDMLKDNGFDKVKLFDADETILDALSGTDIEIMLAVPNYMLAEMSSDASAAASWVDANVTAYAYPGGVNIKYVAVGNEPFLKTYNGTYLQQTLPALKNIQEAINNAGLGSKIKATVPFNADIYNSPESNPVPSAGDFRPEIRDLTVQIVQYLYSNDAPFVVNIYPFLSLYSNAYFPLDFAFFDGSNKPLRDGSSAYTNVFDANL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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