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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000770`

染色体: Chr06 坐标: 7198483-7202522 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000770`
名称	SmilChr06G000770
描述	nudix hydrolase 20, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7198483 - 7202522 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988318`
GeneID	`130988318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988318`
原始查询	`SmilChr06G000770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 20, chloroplastic-like
产物	nudix hydrolase 20%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G19460` (NUDT20) nudix hydrolase homolog 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832066] identity=57.2; qcov=1.02; evalue=3.75e-150; confidence=high
Rice	`Os09g0322200` - identity=54.5; qcov=0.397; evalue=5.52e-46; confidence=low
GO	GO:0044715 (8-oxo-dGDP phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF15916 (DUF4743)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057768118.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057768118.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057768118.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768118.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7198643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:7198721`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C28
`Chr6:7198721`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C28
`Chr6:7198733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:7200058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B78
`Chr6:7200058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:7200239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:7200737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B3,C83
`Chr6:7201120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C69
`Chr6:7201386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr6:7201395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768118.1

360 aa

180

360

DUF4743

NUDIX

PF15916 DUF4743 69-191 aa PF00293 NUDIX 200-312 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768118.1`	Pfam	`PF15916`	DUF4743	Family	69	191	4.7e-33	114.4	Domain of unknown function (DUF4743)
`XP_057768118.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	200	312	1.9e-08	35.1	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912135.1
GGAGTATAAAATTCGAATAGATTTTGTTGTTTGAGTTTGAAAAATGGCAATCACACTCTTTCCTTCATTTGTTTGTTCATCTTCTTCTATTAGAAGGTGGGGTGCGAATTTACCAATTCGCCCTCCTTTTCAGTCGGTCGGTTCCGCCGCCGCCTTCCAGCACACTCTCGCCGGGAGCAGCAACTTCACGTGGAACGACGTCGTCGGCTTATTCCCCAATCATGACTCTTCCGACCTCCGCGGCTTCTTCGGCAAAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988318
ATGGCAATCACACTCTTTCCTTCATTTGTTTGTTCATCTTCTTCTATTAGAAGGTGGGGTGCGAATTTACCAATTCGCCCTCCTTTTCAGTCGGTCGGTTCCGCCGCCGCCTTCCAGCACACTCTCGCCGGGAGCAGCAACTTCACGTGGAACGACGTCGTCGGCTTATTCCCCAATCATGACTCTTCCGACCTCCGCGGCTTCTTCGGCAAAGTTGCTCTATGCAATCGCAATTCTGAGAAGATGTGTGAATTTATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768118.1
MAITLFPSFVCSSSSIRRWGANLPIRPPFQSVGSAAAFQHTLAGSSNFTWNDVVGLFPNHDSSDLRGFFGKVALCNRNSEKMCEFMPFVIEEQVVGYVHNGFADHLRTFKDVFTYPEDSSYGGNFGCHLALHPLLRTPEDRTKAVADVVKCFADRLIPGIRNELYPVTSSFGTPEYFSLERAAAPYFGIKAYGIHLNGYVEREDQDYLWVGKRSNTKSKYPGQLDHLVAGGLPHGISCVENVVKECKEEAGIPRFISSKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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