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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000777`

染色体: Chr06 坐标: 7303282-7307508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000777`
名称	SmilChr06G000777
描述	protein arginine N-methyltransferase PRMT10
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7303282 - 7307508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988324`
GeneID	`130988324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988324`
原始查询	`SmilChr06G000777`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein arginine N-methyltransferase PRMT10
产物	protein arginine N-methyltransferase PRMT10
Arabidopsis	`AT1G04870` (PRMT10) protein arginine methyltransferase 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839393] identity=68.7; qcov=0.902; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0142800` (OsPRMT710) - identity=68.3; qcov=0.907; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016274 (protein-arginine N-methyltransferase activity); GO:0018216 (peptidyl-arginine methylation)
KEGG	-
Pfam	PF05175 (MTS); PF05185 (PRMT5); PF06325 (PrmA); PF08241 (Methyltransf_11); PF13649 (Methyltransf_25); PF13847 (Methyltransf_31); PF22528 (PRMT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768123.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768123.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768123.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768123.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7303456`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr6:7303456`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr6:7306295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:7307031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:7307058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:7307089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B135,B56,B96,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768123.1

397 aa

198

397

PRMT5

Methyltransf_31

MTS

PrmA

Methyltransf_25

Methyltransf_11

PRMT_C

PF05185 PRMT5 79-165 aa PF13847 Methyltransf_31 83-198 aa PF05175 MTS 84-156 aa PF06325 PrmA 84-157 aa PF13649 Methyltransf_25 88-184 aa PF08241 Methyltransf_11 89-186 aa PF22528 PRMT_C 208-380 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF05185`	PRMT5	Domain	79	165	5.3e-05	23.8	PRMT5 arginine-N-methyltransferase
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF13847`	Methyltransf_31	Domain	83	198	4.1e-07	30.6	Methyltransferase domain
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF05175`	MTS	Domain	84	156	1.1e-06	29.1	Methyltransferase small domain
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF06325`	PrmA	Family	84	157	2.5e-11	44.3	Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA)
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	88	184	6.9e-11	43.4	Methyltransferase domain
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	89	186	2.6e-10	41.5	Methyltransferase domain
`XP_057768123.1`	Pfam	`PF22528`	PRMT_C	Domain	208	380	2e-22	80.6	Arginine methyltransferase oligomerization subdomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912140.1
ACATGTGCCCTAGTGCAAGAACCGATTTTTGTGTTCGCACTTTCTCCCTCGATACCAATCCGCAGACAGCGCTACCGCGTAAATTAAAAATGGGAAGCAGCGCCGCCGCGAACGGCGTCGTAGACAAGGGCGTGGATTTTGCCAACTATTTCTGCACATATGGCTTCCTCTACCACCAGAAAGAGATGCTCTGCGACCGCGTTCGGATGGACGCCTACTACAACGCCGTTTTCGAGAACAAGCACCATTTTAAGGGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988324
ATGTGCCCTAGTGCAAGAACCGATTTTTGTGTTCGCACTTTCTCCCTCGATACCAATCCGCAGACAGCGCTACCGCGTAAATTAAAAATGGGAAGCAGCGCCGCCGCGAACGGCGTCGTAGACAAGGGCGTGGATTTTGCCAACTATTTCTGCACATATGGCTTCCTCTACCACCAGAAAGAGATGCTCTGCGACCGCGTTCGGATGGACGCCTACTACAACGCCGTTTTCGAGAACAAGCACCATTTTAAGGGGAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768123.1
MCPSARTDFCVRTFSLDTNPQTALPRKLKMGSSAAANGVVDKGVDFANYFCTYGFLYHQKEMLCDRVRMDAYYNAVFENKHHFKGKVVLDVGTGSGILAIWSAQAGARKVYAVEATKMSEHARELIKANKLQDVVEVIEGSMEDIVLPEKVDVIISEWMGYFLLRESMLDSVLCARDRWLKPDGVMYPSHARIWMSPIRSGLVDQKMRDYDGSMADWSGFIKETEAFYGVDMSALTKPFDEEQKKYYLQTSLWNNLHPNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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