当前解析结果
SmilChr06G000791| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000791 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000791 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000791 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 7456169 - 7456936 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990429 |
|---|---|
| GeneID | 130990429 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990429 |
| 原始查询 | SmilChr06G000791 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990429 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057770646.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057770646.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770646.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770646.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770646.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:7456174 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:7456197 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 116 | A1,A10,A15,A16,A21,A23,A24,A5,A8,A9,B10,B101,B107,B108,B11,B111,B112,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B125,B129,B13,B131,B132,B136,B137,B138,B15,B18,B2,B20,B25,B26,B28,B29,B3,B31,B34,B4,B40,B42,B44,B45,B46,B48,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B6,B62,B64,B66,B68,B69,B70,B71,B73,B76,B77,B80,B81,B84,B85,B89,B9,B92,B95,B97,C1,C10,C11,C14,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C25,C27,C28,C30,C32,C34,C41,C45,C46,C48,C5,C52,C58,C6,C62,C63,C67,C69,C7,C72,C74,C76,C78,C83,C87,D10,D2,D3,D5,D7 |
Chr6:7456200 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C1,C58,C64,C66 |
Chr6:7456274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:7456295 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C78 |
Chr6:7456297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr6:7456301 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:7456325 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B104 |
Chr6:7456325 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr6:7456342 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B24 |
Chr6:7456342 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr6:7456354 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。