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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000810`

染色体: Chr06 坐标: 7598922-7610826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000810`
名称	SmilChr06G000810
描述	uncharacterized SmilChr06G000810
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7598922 - 7610826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990431`
GeneID	`130990431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990431`
原始查询	`SmilChr06G000810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsLPLA; symbol=OsLPLA; hit=Os08g0435800; species=rice; confidence=medium
产物	OsLPLA; symbol=OsLPLA; hit=Os08g0435800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G29010` (AT3G29010) Biotin/lipoate A/B protein ligase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822541] identity=62.5; qcov=0.438; evalue=2.07e-63; confidence=low
Rice	`Os08g0435800` (OsLPLA) - identity=59.5; qcov=0.465; evalue=8.72e-64; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF21948 (LplA-B_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770647.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057770647.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770647.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057770647.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7604984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C63
`Chr6:7604984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr6:7605006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B40,B93
`Chr6:7605140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B62,C16,C47,C52
`Chr6:7605539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C87
`Chr6:7605691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C49
`Chr6:7605722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:7605733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B97,C28,C46,C81
`Chr6:7605831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr6:7606086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:7606087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C43,C78
`Chr6:7606107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770647.1

329 aa

164

329

LplA-B_cat

PF21948 LplA-B_cat 52-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770647.1`	Pfam	`PF21948`	LplA-B_cat	Domain	52	167	1.1e-25	91.5	Lipoyl protein ligase A/B catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914664.1
ATGGAGATTAGGTTGGGAGATGACTGTGTTCCATCTCATTTTGTTGCTGTGGTGATGGCTTGGAGCCGCTTTTATGTTACCATATCTCACGTCAATCCTAAATCTTCACCTTTCATACGCACTCTCAGTTTCGCCACCTCCACCACTATAAGGAAACCTAAGGAACTTCTTGAAACTGATGCTGTTCTAAGAGATGAAATTCCAGTCATCCGAAGGTTTACAGGAGGTGGTACTGTTATTGTTGATCAGGGCACTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990431
ATGGAGATTAGGTTGGGAGATGACTGTGTTCCATCTCATTTTGTTGCTGTGGTGATGGCTTGGAGCCGCTTTTATGTTACCATATCTCACGTCAATCCTAAATCTTCACCTTTCATACGCACTCTCAGTTTCGCCACCTCCACCACTATAAGGAAACCTAAGGAACTTCTTGAAACTGATGCTGTTCTAAGAGATGAAATTCCAGTCATCCGAAGGTTTACAGGAGGTGGTACTGTTATTGTTGATCAGGGCACTATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770647.1
MEIRLGDDCVPSHFVAVVMAWSRFYVTISHVNPKSSPFIRTLSFATSTTIRKPKELLETDAVLRDEIPVIRRFTGGGTVIVDQGTIFVSFICNKDVIPGLQSYPRPIMSWSSLIYKNMFQGIGEFGLRENDYVLGNRKFGGNAQSITKNRWVHHTSFLWDYEVGNMGYLKMPTRVPEYRQGTIFVSFICNKDAIPGLQSYPRPIMSWSSLIYKNMFQGIGEFGLRENDYVLGNRKFGGNAQSITKNRERRKSADELTAPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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