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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000827`

染色体: Chr06 坐标: 7780996-7781415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000827`
名称	SmilChr06G000827
描述	uncharacterized SmilChr06G000827
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	7780996 - 7781415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990438`
GeneID	`130990438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990438`
原始查询	`SmilChr06G000827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.3; qcov=0.748; evalue=1.33e-18; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=52.3; qcov=1.1; evalue=8.4e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057770653.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770653.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057770653.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770653.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770653.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:7780999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A21,A3,B102,B111,B118,B122,B136,B14,B140,B28,B33,B41,B48,B63,B68,B77,B94,B98,B99,C12,C17,C27,C33,C5,C54,C58,C6,C80,D2,D4,D5
`Chr6:7781000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C16,C52
`Chr6:7781096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B25,C49,C9
`Chr6:7781103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:7781111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C61,D3
`Chr6:7781148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C69
`Chr6:7781176`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A3,B106,C47,C69
`Chr6:7781176`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A3,B106,C47,C69
`Chr6:7781187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B106,C47,C58,C69
`Chr6:7781272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C35,C64,C66,C81
`Chr6:7781282`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,B88,C11,C29,C47,C58,C69
`Chr6:7781329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770653.1

139 aa

139

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 69-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770653.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	69	139	1.6e-24	87.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914670.1
ATGCGAAGAGAGTTATTTGTGAAGATCGTTGATGCGTTGAGCAACTTCTCCCCCTACTTCACGTTGAGGCAAGATGCAACTATCCGACAATTGGCATATGCATCTCCCAGTGACTCACTCGATGATTACATGCGGATGGGTGAGAGTACTGCGTTAGAATGTCTACATGAATTTTGCAGGAACGTGATTGCCGTTTATGGTGATCGTTATTTGAGGACTCCAAATGCAGTAGATACCCAATGCTTGTTACAAATGCATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990438
ATGCGAAGAGAGTTATTTGTGAAGATCGTTGATGCGTTGAGCAACTTCTCCCCCTACTTCACGTTGAGGCAAGATGCAACTATCCGACAATTGGCATATGCATCTCCCAGTGACTCACTCGATGATTACATGCGGATGGGTGAGAGTACTGCGTTAGAATGTCTACATGAATTTTGCAGGAACGTGATTGCCGTTTATGGTGATCGTTATTTGAGGACTCCAAATGCAGTAGATACCCAATGCTTGTTACAAATGCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770653.1
MRRELFVKIVDALSNFSPYFTLRQDATIRQLAYASPSDSLDDYMRMGESTALECLHEFCRNVIAVYGDRYLRTPNAVDTQCLLQMHEERHGFPGMLGSHGCMHWEWINCPVAYKGYYTRDDHCVPTIVLEAVASTDLWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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