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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000861`

染色体: Chr06 坐标: 8140727-8145536 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000861`
名称	SmilChr06G000861
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8140727 - 8145536 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988394`
GeneID	`130988394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988394`
原始查询	`SmilChr06G000861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
产物	PHD finger protein ALFIN-LIKE 4-like
Arabidopsis	`AT3G42790` (AL3) alfin-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823316] identity=74.5; qcov=1.02; evalue=1.88e-122; confidence=high
Rice	`Os04g0444900` - identity=61.9; qcov=1.04; evalue=1.69e-112; confidence=high
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF12165 (Alfin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768202.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057768202.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057768202.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768202.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8140976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr6:8142367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr6:8143287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C43,C78
`Chr6:8143376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B74
`Chr6:8145124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768202.1

246 aa

123

246

Alfin

PHD

PF12165 Alfin 11-138 aa PF00628 PHD 193-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768202.1`	Pfam	`PF12165`	Alfin	Family	11	138	6.2e-68	227.2	Alfin
`XP_057768202.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	193	239	1.9e-09	38.1	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912219.1
GGACTCGAGAGAGAGATGGAGAGTTTGAGAGAAGGGGGTCAATTTCGTCGCTCTTTCAAAATAAAGTTGCTATCCATTTGGCTGCCATCTCAGAAAAGCCACCACCAAATCCACATAATTCCATTCATGCCCCCAATTTCCGCCCTTTCCTCCCTCTATAACTCTCCGATTCTTTTCATTTTCAAACCATAACTCACATACTCCAGTGTGTTTGTGCGTGTAAATAGCTACTGCGATGGACGGAGGTGCGGTCAACAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988394
ATGGACGGAGGTGCGGTCAACAACCCTCGCACGGTTGAGGAGGTTTTCAAAGATTTCAAGTGCAGACGCAATGCCTTGATCAAAGCTCTTACCACTGATGTTGAAGACTTCTTCCAGCAGTGTGATCCTGATAAGGAAAATCTGTGTCTTTTTGGATTACCCAATGAGCAATGGGAAGTAAATCTACCTGCAGAGGAGGTGCCTCCAGAGCTTCCAGAACCTGCTTTAGGTATAAACTTTGCCAGAGATGGAATGCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768202.1
MDGGAVNNPRTVEEVFKDFKCRRNALIKALTTDVEDFFQQCDPDKENLCLFGLPNEQWEVNLPAEEVPPELPEPALGINFARDGMQEKDWLALVAVHSDAWLLSVAFYFGARFGFDKAARKRLFNMINDLPTIFEVVTGAAKKQVKEKSSVSNHSGSTSKSNPKLGRMSRPQPKDDDEGLDEEEEDEHGETLCGACGENYASDEFWICCDICERWFHGKCVKITPARAEHIKQYKCPTCTNKRARP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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