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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000889`

染色体: Chr06 坐标: 8412523-8415207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000889`
名称	SmilChr06G000889
描述	uncharacterized SmilChr06G000889
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8412523 - 8415207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988423`
GeneID	`130988423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988423`
原始查询	`SmilChr06G000889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal L18p/L5e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837407]; symbol=AT1G08845; hit=AT1G08845; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal L18p/L5e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837407]; symbol=AT1G08845; hit=AT1G08845; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G08845` (AT1G08845) Ribosomal L18p/L5e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837407] identity=85.2; qcov=0.852; evalue=2.93e-98; confidence=high
Rice	`Os10g0559900` (OSJNBa0042H09.18) - identity=81.3; qcov=0.852; evalue=7.63e-96; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0008097 (5S rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00861 (Ribosomal_L18p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768236.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057768236.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768236.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768236.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8412652`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B84
`Chr6:8412652`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B84
`Chr6:8412953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8413339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768236.1

182 aa

182

Ribosomal_L18p

PF00861 Ribosomal_L18p 60-176 aa

XP_057768238.1

182 aa

182

Ribosomal_L18p

PF00861 Ribosomal_L18p 60-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768236.1`	Pfam	`PF00861`	Ribosomal_L18p	Family	60	176	3.4e-07	31.3	Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
`XP_057768238.1`	Pfam	`PF00861`	Ribosomal_L18p	Family	60	176	3.4e-07	31.3	Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912253.1
ACTAAAAAATCACAACACAAATTAGGGCAGGTAGCACAGCAGCGTTTCACAATCGCATCTCTCATTCTCTCTGCATCTCTGGCGCGGCGCGGCCTGTCCTTGCGTCTCTCCCACTCCCGGTGACCGGCGTTTCTTCCCACCAGAGACCGGCGCTGCCCCCCGTGCTCTGTGCTCAGCCTCTAAACATCCTAGCCGCAGCCGCCTCCCAACACCGGCCACACCAACCCGCACATCCGGACGCCGGCCACACCAGCACGGCG...

XM_057912255.1
AGGTAGCACAGCAGCGTTTCACAATCGCATCTCTCATTCTCTCTGCATCTCTGGCGCGGCGCGGCCTGTCCTTGCGTCTCTCCCACTCCCGGTGACCGGCGTTTCTTCCCACCAGAGACCGGCGCTGCCCCCCGTGCTCTGTGCTCAGCCTCTAAACATCCTAGCCGCAGCCGCCTCCCAACACCGGCCACACCAACCCGCACATCCGGACGCCGGCCACACCAGCACGGCGACACGCCGTTGACTCCGGCAGCCTGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988423
ATGTTCAGACTAGCGTTCCGCAAGTTATGTGCTCGTGTAGATGGAGGATGTGAAATCAGGCCTTTATCACAGTTTCGCAGTTTTCACTCTGCTCAGCCTTCTTTGGCCCCAAGAAGCTTTTTTGGTGTCGAAGATTTTCTTGATGACGATAATAGCAGGCCATACACTTATCAGAAAGAAAAGAAGTCGAGAAATCCAAACAAGCACGTATCCTTCAAACAGCGTACCGTTGCTTACATGGAGCCGTTTACACTGGACGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768236.1
MFRLAFRKLCARVDGGCEIRPLSQFRSFHSAQPSLAPRSFFGVEDFLDDDNSRPYTYQKEKKSRNPNKHVSFKQRTVAYMEPFTLDVFISKRFVSASITHRVTCKQVAVAGTNSKDIKAALRSRSDIPACLAIGQILSDRAREADVYTASYTPRERDKFEGKIRAVVQSLIDNGIDVKIYLD

XP_057768238.1
MFRLAFRKLCARVDGGCEIRPLSQFRSFHSAQPSLAPRSFFGVEDFLDDDNSRPYTYQKEKKSRNPNKHVSFKQRTVAYMEPFTLDVFISKRFVSASITHRVTCKQVAVAGTNSKDIKAALRSRSDIPACLAIGQILSDRAREADVYTASYTPRERDKFEGKIRAVVQSLIDNGIDVKIYLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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