当前解析结果
SmilChr06G000892| 统一新 Gene ID | SmilChr06G000892 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G000892 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G000892 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 8425369 - 8426079 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990444 |
|---|---|
| GeneID | 130990444 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990444 |
| 原始查询 | SmilChr06G000892 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=30.9; qcov=0.975; evalue=6.32e-25; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990444 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770661.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057770661.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057770661.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057770661.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770661.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:8425384 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C20,C3 |
Chr6:8425387 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B54 |
Chr6:8425387 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr6:8425395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr6:8425413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr6:8425432 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr6:8425500 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr6:8425574 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B92 |
Chr6:8425580 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B92,C39 |
Chr6:8425648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,B51 |
Chr6:8425650 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B16,B32,C7 |
Chr6:8425666 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B113,B20,B3,B45,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。