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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000903`

染色体: Chr06 坐标: 8502533-8508279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000903`
名称	SmilChr06G000903
描述	casein kinase 1-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8502533 - 8508279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988434`
GeneID	`130988434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988434`
原始查询	`SmilChr06G000903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	casein kinase 1-like protein 2
产物	casein kinase 1-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G72710` (CKL2) casein kinase 1-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843603] identity=75.5; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0570500` (B1114B07.27-1) - identity=75.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006897 (endocytosis); GO:0007165 (signal transduction); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF17667 (Pkinase_fungal)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768249.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768249.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057768249.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768249.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8503232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:8503554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C85
`Chr6:8503571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C85
`Chr6:8503808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:8503947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768249.1

475 aa

238

475

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase_fungal

PF00069 Pkinase 9-227 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 11-269 aa PF17667 Pkinase_fungal 110-206 aa

XP_057768250.1

474 aa

237

474

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase_fungal

PF00069 Pkinase 9-227 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 11-269 aa PF17667 Pkinase_fungal 110-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768249.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	9	227	9.3e-27	94.8	Protein kinase domain
`XP_057768249.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	11	269	7.1e-16	59.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057768249.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	110	206	3e-08	33.5	Fungal protein kinase
`XP_057768250.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	9	227	9.3e-27	94.8	Protein kinase domain
`XP_057768250.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	11	269	7e-16	59.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057768250.1`	Pfam	`PF17667`	Pkinase_fungal	Domain	110	206	3e-08	33.5	Fungal protein kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912267.1
CCCACGCGCCGCCCTGGCGCGTGTCCACACCGCTCCTTATACTTATTTTGACAACCGAATCAAGCGAAAAAAACCTTCACACTGAAAGACACACGCACACAGTAATATATATGTCAACACAGTTGCTGAAGAAGAATTTTTTCCCCTTTCTTCTCTCTTCACCCTCCCTCTCTATCTCTCTAACTCTTAACCCTAGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTAGAAGTGGGATTAATCTCCATCAAGTCGTTTCACTTATTAGA...

XM_057912266.1
CCCACGCGCCGCCCTGGCGCGTGTCCACACCGCTCCTTATACTTATTTTGACAACCGAATCAAGCGAAAAAAACCTTCACACTGAAAGACACACGCACACAGTAATATATATGTCAACACAGTTGCTGAAGAAGAATTTTTTCCCCTTTCTTCTCTCTTCACCCTCCCTCTCTATCTCTCTAACTCTTAACCCTAGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTAGAAGTGGGATTAATCTCCATCAAGTCGTTTCACTTATTAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988434
ATGGAGCCGCGAGTTGGAAACAAGTATCGACTGGGTCGGAAGATTGGCAGTGGATCCTTTGGAGAGATCTATCTTGGGACAAATATTCAGACTAATGATGAAGTGGCAATTAAGCTAGAAAATGTGAAGACAAAACATCCTCAATTGCTCTACGAGTCAAAGTTGTACAGAATTCTACAAGGCGGAACTGGGATACCGAATGTAAGATGGTTTGGTGTGGAAGGAGACTACAATGTTCTGGTTATGGACTTGCTTGGACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768249.1
MEPRVGNKYRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNDEVAIKLENVKTKHPQLLYESKLYRILQGGTGIPNVRWFGVEGDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVHSKSFLHRDIKPDNFLMGLGRRANQVYVIDFGLAKKYRDSSTHQHIPYRENKNLTGTARYASMNTHLGIEQSRRDDLESLGFVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEALCRGYPTEFASYFHYCRSLRF...

XP_057768250.1
MEPRVGNKYRLGRKIGSGSFGEIYLGTNIQTNDEVAIKLENVKTKHPQLLYESKLYRILQGGTGIPNVRWFGVEGDYNVLVMDLLGPSLEDLFNFCSRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVHSKSFLHRDIKPDNFLMGLGRRANQVYVIDFGLAKKYRDSSTHQHIPYRENKNLTGTARYASMNTHLGIEQSRRDDLESLGFVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISEKKVSTSIEALCRGYPTEFASYFHYCRSLRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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