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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000914`

染色体: Chr06 坐标: 8664836-8667006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000914`
名称	SmilChr06G000914
描述	putative GATA transcription factor 22
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8664836 - 8667006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988447`
GeneID	`130988447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988447`
原始查询	`SmilChr06G000914`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative GATA transcription factor 22
产物	putative GATA transcription factor 22
Arabidopsis	`AT4G26150` (CGA1) cytokinin-responsive gata factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828721] identity=44.8; qcov=0.827; evalue=1.11e-38; confidence=medium
Rice	`Os06g0571800` (OsGATA16) - identity=29.8; qcov=1.05; evalue=2.39e-25; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00320 (GATA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768267.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768267.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768267.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768267.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768267.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8665117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr6:8665335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C72
`Chr6:8665383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:8665416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:8665520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B1,B72,D10,D11
`Chr6:8666592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768267.1

300 aa

150

300

GATA

PF00320 GATA 167-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768267.1`	Pfam	`PF00320`	GATA	Domain	167	201	8.8e-17	61.1	GATA zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912284.1
GTCACGTGAATGCCTGCAGCCTCAATTTCCCCCCTTCGCCTTCCCCTTCCCTTTATAACACCCTCTTACCTCACCTCATTAGCCCCTTTTACACACACATCACACACTACTTCCTCAACACCACTTCCATTTTCCTCGAATTGGATCAACAAAGGAAAACATTTGCCCTTTTCTTCACTCATCTTTTTTGTTTTCTTACTCACAAATGAACTTAAACTCTCCCCCTCCTTCACATTTTCCTATGCACCAAATTACTAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988447
ATGAACTTAAACTCTCCCCCTCCTTCACATTTTCCTATGCACCAAATTACTAGTCATGACAATGATCATGAGCACCCCTTCCTCCCAAATCGATCCTCTTCTGTCTCTTGTCATTTTTTCTTCGATCCCACTCGCGATCACGCCGGATTCTACGATCATCCCCAACTCTACCAACCTACTCATCATATCGCGGGTGATCAGAACTACGGGTACCACGGCGGATCAGCATACGAGACGAAGAGCGTGGACGAGAGCAGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768267.1
MNLNSPPPSHFPMHQITSHDNDHEHPFLPNRSSSVSCHFFFDPTRDHAGFYDHPQLYQPTHHIAGDQNYGYHGGSAYETKSVDESSLKLTLWKKEDDDELQISSNNNSNPMRWMSSKMRVMQKMKKTDHDRAAAVKTTAQQPSSSSAETDLSSNSSSYNNNSPIRVCSDCNTTKTPLWRSGPKGPKSLCNACGIRQRKARRAMAAAANGAAANGGGQPPAMKIKLQQKGKNGQAASQLKKRCKTSAVAAAAAGGNVQKRI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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