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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000920`

染色体: Chr06 坐标: 8743772-8744641 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000920`
名称	SmilChr06G000920
描述	PRA1 family protein F3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8743772 - 8744641 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988454`
GeneID	`130988454`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988454`
原始查询	`SmilChr06G000920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PRA1 family protein F3-like
产物	PRA1 family protein F3-like
Arabidopsis	`AT3G13710` (PRA1.F4) prenylated RAB acceptor 1.F4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820580] identity=44.8; qcov=0.978; evalue=2.17e-44; confidence=medium
Rice	`Os05g0200280` (P0708D12.1) - identity=47.7; qcov=0.838; evalue=1.06e-27; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF03208 (PRA1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988454

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057768294.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057768294.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057768294.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057768294.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057768294.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8744002`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10
`Chr6:8744002`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B10
`Chr6:8744004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr6:8744390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D2
`Chr6:8744403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B26,C40,C87,D2
`Chr6:8744406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B26,C40,C87,D2
`Chr6:8744458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:8744463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B26,C40,C87,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768294.1

185 aa

185

PRA1

PF03208 PRA1 27-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768294.1`	Pfam	`PF03208`	PRA1	Family	27	161	2.1e-38	131.8	PRA1 family protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912311.1
ACTCTTCTCGTGTGATATACTATCGTGATAATTATTTTATTTATGAATAAACAGTAGTTATAATTAAACATAATAAAAGGAATGAATTACATTTTCAAGAGCATGTAAAAGAGAGATCGAATGTGGAGTGCGAATTCCATACCACGAAATCTAACATCTCTCATCTTCTTGATCCACACAAAATGAGCACCATCTACGGCACAATATCCACCGCCGCACCACCGCCGGACTCGCCGTTCCTCTCCCGGATCCGATCGGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988454
ATGAGCACCATCTACGGCACAATATCCACCGCCGCACCACCGCCGGACTCGCCGTTCCTCTCCCGGATCCGATCGGGGATCGGGACGCGGCGGTCGTGGCGGGTGATGGTCACCTCCCTCTCCATGCCGGAGAGCGTGGGCGCCGCCGTCCAGCGCCTCCGCACGAACGCCTCCTATTTCCACGTGAACTACGCCATCGTGGTCCTCTTCACGCTCTTCGTGAGCCTCCTATGGCACCCGGGGGCCCTCATCGTCTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768294.1
MSTIYGTISTAAPPPDSPFLSRIRSGIGTRRSWRVMVTSLSMPESVGAAVQRLRTNASYFHVNYAIVVLFTLFVSLLWHPGALIVFTATMFAWLFLYFLRDTPLVVWGYGVEERVVLVVLSISTVALLLLTQATIFLGGIAAGLAASLAHGVFRRTNDLDFDDEDGGGGAAVGLRETASATYSVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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