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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000921`

染色体: Chr06 坐标: 8745940-8747389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000921`
名称	SmilChr06G000921
描述	tetraspanin-2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8745940 - 8747389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988456`
GeneID	`130988456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988456`
原始查询	`SmilChr06G000921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tetraspanin-2-like
产物	tetraspanin-2-like
Arabidopsis	`AT2G19580` (TET2) tetraspanin2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816477] identity=63.8; qcov=1; evalue=3.44e-119; confidence=high
Rice	`Os06g0572400` (OsTET9) - identity=56.7; qcov=1; evalue=2.46e-91; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0009734 (auxin-activated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF00335 (Tetraspanin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057768295.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768295.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768295.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768295.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8746031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C76
`Chr6:8746066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B92,C7
`Chr6:8746147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D2
`Chr6:8746213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8746830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr6:8746939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr6:8747062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:8747150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B7,C84
`Chr6:8747203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B91,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768295.1

270 aa

135

270

Tetraspanin

PF00335 Tetraspanin 6-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768295.1`	Pfam	`PF00335`	Tetraspanin	Family	6	251	3.8e-31	109.2	Tetraspanin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912312.1
GCTGTTAATGATGACAAAAAGGAAAAGAAAATTTTATGATGACGTTGACTCATGTCCATCACTTTGCTCCCTTCTTTTCAGTGTAATGTATTAAAATAGTAGTCAGTCTAACTGTAAATGTTCTGTTTCTATTTCCATTTCCCAAAGCAGATCCAGCAATCATGGCGGTGAGCAACAGCATCACGGCGATCCTCAACTTCGTGGCGATGATGTGCTCCTTCCCCATCATCGCCGCCGGCGTCTGGCTGGCGTCGCGGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988456
ATGGCGGTGAGCAACAGCATCACGGCGATCCTCAACTTCGTGGCGATGATGTGCTCCTTCCCCATCATCGCCGCCGGCGTCTGGCTGGCGTCGCGGGCGGACAACGAGTGCCTCCTGTGGCTCCGGTGGCCGCTCGTCTTCCTCGGCCTCGCCTTCCTGCTGGTCTCCGCCGCCGGATTCGTCGGCGCCTACTGGAAGAAGGAGGGCCTCCTGGCCATCTACCTCGTCGCCATGTTCATCCTCATCGTGGTGCTGCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768295.1
MAVSNSITAILNFVAMMCSFPIIAAGVWLASRADNECLLWLRWPLVFLGLAFLLVSAAGFVGAYWKKEGLLAIYLVAMFILIVVLLVILVLAFVVTRPDGGAVVGGGVGFKEYRLDGFSSWLRDHVTATDNWGKIRACLAASQICPKLTHKFVSAPDFFAAHLSPLQSGCCKPPLMCGLEYSSPTTWLGQPNLAAGADCGVWSNDPRQLCYNCDSCKAGLLGNLREEWRKTNVILIITVVLLIWVYLIACSAYRNAQTEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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