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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000929`

染色体: Chr06 坐标: 8821446-8826273 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000929`
名称	SmilChr06G000929
描述	protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8821446 - 8826273 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988465`
GeneID	`130988465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988465`
原始查询	`SmilChr06G000929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2-like
产物	protein EFFECTOR OF TRANSCRIPTION 2-like
Arabidopsis	`AT5G56780` (ET2) effector of transcription2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835780] identity=42.9; qcov=0.827; evalue=3.14e-42; confidence=medium
Rice	`Os07g0586700` (OJ1113_E01.111) - identity=41.8; qcov=0.848; evalue=6.58e-36; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF19239 (GIY_YIG_domain)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768307.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768307.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768307.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768307.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8821929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,D10
`Chr6:8821981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A14,C83
`Chr6:8821981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C83
`Chr6:8821983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C39,C56
`Chr6:8822077`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:8822077`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:8822085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8825677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:8826104`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B37,C76
`Chr6:8826104`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B37,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768307.1

231 aa

116

231

GIY_YIG_domain

PF19239 GIY_YIG_domain 56-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768307.1`	Pfam	`PF19239`	GIY_YIG_domain	Domain	56	196	2.6e-54	184.1	GIY-YIG domain-containing protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912324.1
AAATAAAACAAAAACCGCCCGCCAGAATCTCCCTTTGGACGGTTGTTTTTCTTCAAAGCATTTTCATTCCTCATCCTAACCATTTTGCAAATCTTTCCCCCATTATTCTCTCTTCCCTTTCTTTCTCCATCAAACACAATCTTTCTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTCCTGTCTTTTTCAAGATTTAAATCTCCATTTTCACCACATTATCGTGTTGATTGATGATTTATATATGGTACTTTTCTAGGGTCACTTTTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988465
ATGAGTAGTTTGAAAATGATGGGAGCGTATGTAGTTAAGAAAGGGTGCAGGAAATGGTATGGGCAGGGATGTATGTTGAGCTTCACATGCAAGAGGCTTCTCTCATCTTCTTCTATTCCAAGGATCAATAGAGAAGACATCAAATCTATCTCATATGACTCCTCTTTCTCTCCATGGAAGATTCTAATAGGAGGTCGGGATTGGAGAGAGCATTCATCCGGAAAAGAAGGAGCAGAAAGATACAGAACTCAAAACCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768307.1
MSSLKMMGAYVVKKGCRKWYGQGCMLSFTCKRLLSSSSIPRINREDIKSISYDSSFSPWKILIGGRDWREHSSGKEGAERYRTQNLPTHTTPGAYELGIATSAAPARNLEAASVIPVYLGHAGDVRARLQRYGRSGAHLGHHLFSGVFSTDLPIVYRWARMESKERAERMEDELLGLYDYAWNKRNNAHRRPHHILSMLTHKQSQFHFSTFLLLYLKTIKCSMLTFCTPPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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