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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000933`

染色体: Chr06 坐标: 8855261-8859372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000933`
名称	SmilChr06G000933
描述	protein NDL1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8855261 - 8859372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988466`
GeneID	`130988466`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988466`
原始查询	`SmilChr06G000933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NDL1-like
产物	protein NDL1-like
Arabidopsis	`AT5G56750` (NDL1) N-MYC downregulated-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835777] identity=78; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0563000` - identity=70.7; qcov=0.979; evalue=6.79e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03096 (Ndr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988466

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768309.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057768309.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057768310.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768309.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8855727`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A4,A6,B105,B113,B127,B132,B133,B16,B3,B31,B58,B69,B8,C12,C26,C3,C35,C38,C39,C47,C64,C66,C7,C77,C81,C82,D9
`Chr6:8855818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8855880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:8857043`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B121
`Chr6:8857043`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B121
`Chr6:8857533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:8859167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B66,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768309.1

351 aa

176

351

Ndr

PF03096 Ndr 22-304 aa

XP_057768310.1

331 aa

166

331

Ndr

PF03096 Ndr 2-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768309.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	22	304	5e-111	370.7	Ndr family
`XP_057768310.1`	Pfam	`PF03096`	Ndr	Domain	2	284	4.1e-111	371.0	Ndr family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912327.1
TTCTTCAATTCCTATTTTCTTGTATGAGATAGACACAGAAATACAGTGGAAAAGGAGTTGGCAAAAAAAACTAATCTCCATTCTCTGATTCTCTCTCTCAATATTTTGCGTATGGTTGCTCGAATACCCTTCTTCGTGTCTATGGAGGAGACATTCAAAGGAGCGAACAAATAGTTTGTGTGTCAAGAAGAGGCCGCAGCCATGGCTGAACTCAGCGGCGGTTCTCTTTGCCTAGACGTTGAGACGATTTATCTCGGCGG...

XM_057912326.1
CTTCAATTCCTATTTTCTTGTATGAGATAGACACAGAAATACAGTGGAAAAGGAGTTGGCAAAAAAAACTAATCTCCATTCTCTGATTCTCTCTCTCAATATTTTGCGTATGGTTGCTCGAATACCCTTCTTCGTGTCTATGGAGGAGACATTCAAAGGAGCGAACAAATAGTTTGTGTGTCAAGAAGAGGCCGCAGCCATGGCTGAACTCAGCGGCGGTTCTCTTTGCCTAGACGTTGAGACGATTTATCTCGGCGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130988466
ATGGCTGAACTCAGCGGCGGTTCTCTTTGCCTAGACGTTGAGACGATTTATCTCGGCGGAAAGGAACATATTGTACGGACTGGGAGTGGCTCTGTTTCCGTTATAGTGTACGGAGATCCCGACAAGCCAGCTTTAGTCACTTATCCTGATTTAGCTTTAAATCACATGTCTTGTTTCCAAGGGTTGTTCTTTTGTCCAGAAGCTGCAACTTTGCTGCTTCACAATTTCTGTGTATACCATATTAGTCCTCCAGGACATGA...

LOC130988466
ATGGAACATATTGTACGGACTGGGAGTGGCTCTGTTTCCGTTATAGTGTACGGAGATCCCGACAAGCCAGCTTTAGTCACTTATCCTGATTTAGCTTTAAATCACATGTCTTGTTTCCAAGGGTTGTTCTTTTGTCCAGAAGCTGCAACTTTGCTGCTTCACAATTTCTGTGTATACCATATTAGTCCTCCAGGACATGAGTTGGGAGCTGCGGCAATTTGTGCAGATAACCCTGTGCCTTCTCTCAGTGACTTAGCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057768309.1
MAELSGGSLCLDVETIYLGGKEHIVRTGSGSVSVIVYGDPDKPALVTYPDLALNHMSCFQGLFFCPEAATLLLHNFCVYHISPPGHELGAAAICADNPVPSLSDLADQILEVLNYFKLGAVMCMGVMAGAYILTLFAMKFRERVLGLILVSPLCKAPSWTEWLCNKVMSNLLYYYGICSLLKDCLLYRYFSKEVRGSAEVPESDIVQACRKLLDERKSTNVLRFLQAINRRPDITDGLRTLKCRTLIFVGDDSPFHSEAL...

XP_057768310.1
MEHIVRTGSGSVSVIVYGDPDKPALVTYPDLALNHMSCFQGLFFCPEAATLLLHNFCVYHISPPGHELGAAAICADNPVPSLSDLADQILEVLNYFKLGAVMCMGVMAGAYILTLFAMKFRERVLGLILVSPLCKAPSWTEWLCNKVMSNLLYYYGICSLLKDCLLYRYFSKEVRGSAEVPESDIVQACRKLLDERKSTNVLRFLQAINRRPDITDGLRTLKCRTLIFVGDDSPFHSEALHMAANLDRRYSALVEVQACG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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