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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000938`

染色体: Chr06 坐标: 8975643-8978805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000938`
名称	SmilChr06G000938
描述	uncharacterized SmilChr06G000938
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	8975643 - 8978805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988471`
GeneID	`130988471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988471`
原始查询	`SmilChr06G000938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleophosmin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829073]; symbol=AT4G29520; hit=AT4G29520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleophosmin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829073]; symbol=AT4G29520; hit=AT4G29520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G29520` (AT4G29520) nucleophosmin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829073] identity=62.5; qcov=0.878; evalue=4.88e-118; confidence=high
Rice	`Os06g0150400` - identity=63.6; qcov=0.859; evalue=5.36e-102; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057768314.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	1.00000	`XP_057768314.1`
3	Melanosome	Melanosome	0.20000	`XP_057768314.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768314.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:8975797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:8975822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C87
`Chr6:8975910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D10
`Chr6:8975938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C72
`Chr6:8976248`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A11,A21,A25,B100,B106,B108,B115,B119,B125,B129,B130,B132,B133,B135,B137,B138,B2,B26,B32,B35,B51,B52,B57,B66,B68,B79,B85,B88,B98,C28,C34,C4,C42,C47,C50,C54,C6,C64,C83,D1
`Chr6:8976274`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	48	A11,A21,A25,B100,B104,B106,B108,B115,B119,B120,B125,B129,B130,B132,B133,B135,B137,B138,B2,B26,B30,B32,B35,B37,B5,B51,B52,B53,B57,B66,B68,B79,B85,B88,B91,B95,B98,C28,C34,C42,C47,C50,C54,C6,C60,C64,C83,D1
`Chr6:8978453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr6:8978511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B135,B88,C25
`Chr6:8978523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:8978570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B16,B53,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912331.1
AGCGAGCGACGTCGTATAGTCCATTAGTGAAGGAGAAAATAAAGCAGCAATTTTTGCCATTGCAACTGAACTCCTAATCTGTGAGTGTTGTGCGATTTTTTGGGCGCAACAATGACGAAATCCATTAATTCATCACTATTGCTAGTGCTATATGCATTAATGATAGTATGCTCATTGACGCCATTATCGCACAGCGCCAAGAAACCAGTAGGAATTGCTAGAAAAGAAGACATTCCATATATAAAATGTCAAGTTTGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988471
ATGACGAAATCCATTAATTCATCACTATTGCTAGTGCTATATGCATTAATGATAGTATGCTCATTGACGCCATTATCGCACAGCGCCAAGAAACCAGTAGGAATTGCTAGAAAAGAAGACATTCCATATATAAAATGTCAAGTTTGTGAGAAGTTGGCATCTCAAATATACCACCAAGTTGAAGCTAAACGAGCTGAGGTTTCCCCTAAAAAGTTATCGGAATATGAAATTATAGAAATCGCGGAGAATGTTTGCAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768314.1
MTKSINSSLLLVLYALMIVCSLTPLSHSAKKPVGIARKEDIPYIKCQVCEKLASQIYHQVEAKRAEVSPKKLSEYEIIEIAENVCNLKKREADWILKIDVVEKGDKLELVEQDSEGQCNSECKTIERACQEVLGYSDTDAAEYLYKKKPQHDALVKFVCKDLTDACSSKPPPVPKDRAPGEPFVAKSEKEAEMERLMKSMEGMPGAPGMKMYSREDLMNQKFGAEDGDEDDDDDAEEFPSNLGKVLRQKTEKESNWKEQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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