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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G000996`

染色体: Chr06 坐标: 9831437-9833669 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G000996`
名称	SmilChr06G000996
描述	nudix hydrolase 8-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	9831437 - 9833669 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988530`
GeneID	`130988530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988530`
原始查询	`SmilChr06G000996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 8-like
产物	nudix hydrolase 8-like
Arabidopsis	`AT5G47240` (NUDT8) nudix hydrolase homolog 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834771] identity=59.9; qcov=0.868; evalue=2.25e-111; confidence=high
Rice	`Os04g0547900` - identity=56.5; qcov=0.838; evalue=1.71e-104; confidence=high
GO	GO:0035529 (NADH pyrophosphatase activity); GO:0047631 (ADP-ribose diphosphatase activity); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX); PF18290 (Nudix_hydro)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057768395.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057768395.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057768395.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057768395.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:9831521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:9831523`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A18,A4,B105,B115,B127,B20,B37,B44,B56,B69,B78,B93,B96,B99,C17,C24,C28,C34,C38,C51,C61,D9
`Chr6:9831554`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B28,D5
`Chr6:9831554`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B28,D5
`Chr6:9831682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B70,B71,C62
`Chr6:9831879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,D2
`Chr6:9831906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B9
`Chr6:9832158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D10
`Chr6:9832668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B131,B22,B29,C25,C57
`Chr6:9832668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B22,B29,C25,C57
`Chr6:9832699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:9832817`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	210	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A19,A20,A21,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B57,B58,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768395.1

302 aa

151

302

Nudix_hydro

NUDIX

PF18290 Nudix_hydro 50-125 aa PF00293 NUDIX 138-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768395.1`	Pfam	`PF18290`	Nudix_hydro	Domain	50	125	1.6e-28	99.3	Nudix hydrolase domain
`XP_057768395.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	138	256	1.2e-20	74.7	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912412.1
TCATTTTTGAATTGGGACATTATATAAATGGGATGTCCAAAAAGAAAATTGGGGACACTATTATTGGGACAGAGGGTATTATGGAGTAGCTTGAGTAGCAAGGGTAGGAAGGAATAGTACTTGTAAATGGATTGATTGAGCATAAAGAATAAGAATTGATATCTGCTCCCATTTTGCAAGGAATTGAAGATGTGATCCTCCTTAAATATACCTTGGATTCTTCTCGAATAAGAATAATTTTTTTAAGAGAAGAATAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988530
ATGATTGCATCAGAAATAGCAATGTGCCAAATTGCGAGTGTGTTAAGACAGAATTGTTGCAAGAAGAGATATGTGGCAAGTAGTAAGCCAAAACACATATACGCGAGGAGTGGTTTAGATAAGGGAAGGGCGTTGGTGGGGTCGTGGGATGATGAGTACGGCGGAGTGGTTATCGATGCAGCAAGCTTGCCTTCTTCTGCAAACGCCTTTGCATCACAGCTCCGCGCTTCCTTGGGCGTGTGGAGATCCAAGGGGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768395.1
MIASEIAMCQIASVLRQNCCKKRYVASSKPKHIYARSGLDKGRALVGSWDDEYGGVVIDAASLPSSANAFASQLRASLGVWRSKGKKGVWLKLVEEQAELVPVAIKEGFAYHDAEAGYVMLTYWIPNQPCSLPSGPSHQIGIAAFLLNHNNHVLVVKEKCSCVCSGVWKLPTGFIDKSEELFSGAVREVKEETGIDAEFLELVAFRHVHGVALEKSDLLFVCLLKPLSLEIQIDENEIEDAEWISVEELLSQQFYKEDEM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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