当前解析结果
SmilChr06G001004| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001004 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001004 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001004 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 9937067 - 9937616 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988539 |
|---|---|
| GeneID | 130988539 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988539 |
| 原始查询 | SmilChr06G001004 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820805]; symbol=AT3G15630; hit=AT3G15630; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820805]; symbol=AT3G15630; hit=AT3G15630; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G15630 (AT3G15630)plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820805] identity=57.5; qcov=0.727; evalue=7.31e-25; confidence=medium |
| Rice | Os01g0175100- identity=50; qcov=0.727; evalue=7.52e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988539 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057768404.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057768404.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768404.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768404.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768404.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:9937116 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B45,B75,C12,C72 |
Chr6:9937127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,C8 |
Chr6:9937139 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr6:9937204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr6:9937222 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,C27,C82 |
Chr6:9937394 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B7,C42 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。