当前解析结果
SmilChr06G001025| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001025 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001025 |
| 描述 | cytochrome B5-like protein |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 10172171 - 10175083 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988558 |
|---|---|
| GeneID | 130988558 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988558 |
| 原始查询 | SmilChr06G001025 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome B5-like protein |
| 产物 | cytochrome B5-like protein |
| Arabidopsis | AT1G60660 (CB5LP)cytochrome B5-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842360] identity=60.5; qcov=1.02; evalue=6.53e-50; confidence=medium |
| Rice | Os08g0386300- identity=64.2; qcov=0.812; evalue=9.88e-43; confidence=medium |
| GO | GO:0016020 (membrane); GO:0020037 (heme binding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00173 (Cyt-b5) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988558 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057768425.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057768425.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768425.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768425.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768425.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768425.1PF00173
Cyt-b5 45-115 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768425.1 |
Pfam | PF00173 |
Cyt-b5 | Domain | 45 | 115 | 2.5e-24 | 85.8 | Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。