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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001029`

染色体: Chr06 坐标: 10222444-10225281 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001029`
名称	SmilChr06G001029
描述	senescence/dehydration-associated protein At4g35985, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10222444 - 10225281 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988564`
GeneID	`130988564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988564`
原始查询	`SmilChr06G001029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	senescence/dehydration-associated protein At4g35985, chloroplastic-like
产物	senescence/dehydration-associated protein At4g35985%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G15450` (AT4G15450) Senescence/dehydration-associated protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827216] identity=52.8; qcov=1.04; evalue=3.21e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0723100` - identity=47.6; qcov=0.989; evalue=4.38e-108; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06911 (Senescence)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057768432.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057768432.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057768432.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768432.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10222638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C50,D9
`Chr6:10222668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:10222733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10222740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:10222756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:10222778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B139,B32,C4,C48
`Chr6:10222783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:10222793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B28,B3,C68,C83
`Chr6:10222807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,D10
`Chr6:10222837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:10222975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B9
`Chr6:10224619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C30,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768432.1

374 aa

187

374

Senescence

PF06911 Senescence 169-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768432.1`	Pfam	`PF06911`	Senescence	Family	169	354	3e-37	129.0	Senescence domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912449.1
ATTTCCAACATCTTTTCAACCTTTTTGAAGGCGCTCCTCAAAATTTCTTCTGTCACCGAAAGTAACAAGGAATAATCGGCATCAACTTATTCAAGAAGCAGCGAATAAAGTCACTAATTATAGCATCAATCACAGCTCATCATCTCTATTTCGATCTTTGCACATTATCATATATTCTTATTTGCTTCAAGAAATTAACAGTCGTTAACCCTAAAGAAATCAAAGATGAACTGTTGCAGGCCAAAGAAATCAAGAAACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988564
ATGAACTGTTGCAGGCCAAAGAAATCAAGAAACCACAGAAACTCATCATCGCCCACTCATATCCAACAAACATCTAATACTAACGTAAGACACGATCTTCTTCTGAGAATCCCAGAATGCAGGGTTCATCTCATGGACGAGGGCCAAGCCGTCGAGCTCGGCGCCGGCGACTTCGAGCTCCAACGAGTATCCGACAGCAACGTGGCGCTGGCCACCGCCGTTAAAGTCGGGGCGGAGCTCCAGTGGCCGCTGACCATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768432.1
MNCCRPKKSRNHRNSSSPTHIQQTSNTNVRHDLLLRIPECRVHLMDEGQAVELGAGDFELQRVSDSNVALATAVKVGAELQWPLTMDEPVVKLDALHYLFSLPMNDGRPLSYGVAFAETSGGALGHLDAFLTENCSFTAGPSSSGKRSGDIDWKEFAPAVDSYNSLLAKAIAGGTGHIVRGIFKCSNAYTNKVQKGGETILIRAVEEKNTVAPNQIQKSNSNGPNQSKGSLNKSLKRARKLSKMTEKLSKSTLSVVEGAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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