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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001031`

染色体: Chr06 坐标: 10247516-10247857 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001031`
名称	SmilChr06G001031
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10247516 - 10247857 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990471`
GeneID	`130990471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990471`
原始查询	`SmilChr06G001031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like
产物	E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like
Arabidopsis	`AT3G19950` (AT3G19950) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821533] identity=40.7; qcov=0.761; evalue=1.84e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0767600` - identity=43.4; qcov=0.735; evalue=5.81e-15; confidence=low
GO	GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770686.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770686.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770686.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770686.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770686.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770686.1

113 aa

113

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-rbx1

PF13923 zf-C3HC4_2 59-100 aa PF13639 zf-RING_2 59-101 aa PF17123 zf-RING_11 60-87 aa PF13445 zf-RING_UBOX 60-98 aa PF00097 zf-C3HC4 60-100 aa PF12678 zf-rbx1 77-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	59	100	1.9e-10	41.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	59	101	2.2e-12	47.8	Ring finger domain
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	60	87	3.4e-07	30.5	RING-like zinc finger
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	60	98	7.5e-06	26.6	RING-type zinc-finger
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	60	100	3.1e-07	30.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057770686.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	77	101	4.1e-08	34.1	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914703.1
ATGTTGCCGTCCCAGATTCCCATCGACGAGATGTTCGATCTCGACGCAGCGTTGACCATGGACGTTGACTTACCCGATAACCATCAAGAGCGAGAAGAAGAAGATGATGATGAATCCAAGGCGAAGGCTGCCAGCCGCCTGCTCGACGAACTGCCGACGGTGGAAGGCAGCGGCCGGTGTGCAGTTTGCGCGGAGGGGCTCCGCTTAGGCGGGGCGGCTAAGCAGATCCCCTGCGGCCATGTATTCCATCAGCACTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990471
ATGTTGCCGTCCCAGATTCCCATCGACGAGATGTTCGATCTCGACGCAGCGTTGACCATGGACGTTGACTTACCCGATAACCATCAAGAGCGAGAAGAAGAAGATGATGATGAATCCAAGGCGAAGGCTGCCAGCCGCCTGCTCGACGAACTGCCGACGGTGGAAGGCAGCGGCCGGTGTGCAGTTTGCGCGGAGGGGCTCCGCTTAGGCGGGGCGGCTAAGCAGATCCCCTGCGGCCATGTATTCCATCAGCACTGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770686.1
MLPSQIPIDEMFDLDAALTMDVDLPDNHQEREEEDDDESKAKAASRLLDELPTVEGSGRCAVCAEGLRLGGAAKQIPCGHVFHQHCILRWLSLIYSCPLCRQNCPPPGIISSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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