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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001072`

染色体: Chr06 坐标: 10620924-10623334 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001072`
名称	SmilChr06G001072
描述	uncharacterized SmilChr06G001072
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10620924 - 10623334 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988594`
GeneID	`130988594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988594`
原始查询	`SmilChr06G001072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836820]; symbol=AT5G66860; hit=AT5G66860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836820]; symbol=AT5G66860; hit=AT5G66860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G66860` (AT5G66860) Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836820] identity=57.3; qcov=1.04; evalue=2.13e-95; confidence=high
Rice	`Os01g0593500` - identity=36.6; qcov=0.915; evalue=3.04e-41; confidence=medium
GO	GO:0006412 (translation); GO:0008097 (5S rRNA binding); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF14693 (Ribosomal_TL5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768458.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768458.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768458.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768458.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10621124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:10621379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:10621813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B108,B13,B53
`Chr6:10621820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:10622868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768458.1

236 aa

118

236

Ribosomal_TL5_C

PF14693 Ribosomal_TL5_C 144-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768458.1`	Pfam	`PF14693`	Ribosomal_TL5_C	Domain	144	228	1.4e-19	70.9	Ribosomal protein TL5, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912475.1
TTGATTTATGAATGAGTTGTTTACATGAGCCCATCAGTAAGAATTATGAATTTGTGATGAGCCCATAGTGAGCCCAAATATGTTTGAGTTAAACCCTGGCAACAAGAAATGAATCTGAAAACCCTCCTTGGCTTCAACTCCAAATCTCAACGCACTCCATTTTCCGTTCAATCAAATGTCCAAGTGGTGGCGCGCCGCCGCTCAGATACCGGCAGGCCGCTCCTATCACACGATTCAAGCCGTTCCGAGAGAACTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988594
ATGTCCAAGTGGTGGCGCGCCGCCGCTCAGATACCGGCAGGCCGCTCCTATCACACGATTCAAGCCGTTCCGAGAGAACTCTCCGGCCACCGTATCTCCGCCCGCGAACGTGCTCAGGGCCGCATCCCCGCCGTCGTTTTCTCCCAAAACTACGTCCAGAAAAACCCTAGCGATCCGACGTCCGTCGTCGCCTCCAGCTCCGTCTCCCAGAAACTGCTACTAACCACCGAGCGCAAGCAGATTAAGGCCATTCTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768458.1
MSKWWRAAAQIPAGRSYHTIQAVPRELSGHRISARERAQGRIPAVVFSQNYVQKNPSDPTSVVASSSVSQKLLLTTERKQIKAILKDIELPFFCSTAFPLQIRAGSGSSTILQNGKVLPIKIHRDDDGNILNLVFAWAEDGSELKVEVPIVYTGEDACPGLKKGGTLHKIRKSLKYLCPSEHIPQKIEVDVSNLDIEDRVSINDPVVHPSLKLLSKNESIPICKIKATNIEYTKET

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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