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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001077`

染色体: Chr06 坐标: 10702901-10704055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001077`
名称	SmilChr06G001077
描述	uncharacterized SmilChr06G001077
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10702901 - 10704055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990477`
GeneID	`130990477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990477`
原始查询	`SmilChr06G001077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17920` (AT2G17920) nucleic acid binding / zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816302] identity=26.2; qcov=0.607; evalue=1.62e-19; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=29.7; qcov=0.596; evalue=1.74e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770692.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770692.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770692.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770692.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10702935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:10702994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B48,C62
`Chr6:10703001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr6:10703003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B48,C62
`Chr6:10703020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B48,C62
`Chr6:10703045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C65,C66
`Chr6:10703053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C65,C66
`Chr6:10703090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C65,C66
`Chr6:10703107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C65,C66
`Chr6:10703122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C65,C66
`Chr6:10703176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr6:10703219`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770692.1

384 aa

192

384

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 31-105 aa PF14392 zf-CCHC_4 172-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770692.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	31	105	3.2e-18	65.9	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057770692.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	172	217	5e-18	65.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914709.1
ATGGAGGACCAAATGGCCGGACTGAATATCGAGGGAGAGGAAGATGAAATTTTTATTGACGACGAGGTTGCCGGAGAATCCTCGGTATCGGTGGAACTTTGTCTGGTAGGGCGATTTATCACAGAGCAGCCCATTAACTTCACTCTGATGCGCAGTCGTATGGCGGGCGTTTGGAGACCGGGCAAAGGTGTTTTCATGAAAGATATCGGGCAGGGGAGATTCATTTTCCAATTTTTTCATGAAGTCGATTTAAAACGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990477
ATGGAGGACCAAATGGCCGGACTGAATATCGAGGGAGAGGAAGATGAAATTTTTATTGACGACGAGGTTGCCGGAGAATCCTCGGTATCGGTGGAACTTTGTCTGGTAGGGCGATTTATCACAGAGCAGCCCATTAACTTCACTCTGATGCGCAGTCGTATGGCGGGCGTTTGGAGACCGGGCAAAGGTGTTTTCATGAAAGATATCGGGCAGGGGAGATTCATTTTCCAATTTTTTCATGAAGTCGATTTAAAACGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770692.1
MEDQMAGLNIEGEEDEIFIDDEVAGESSVSVELCLVGRFITEQPINFTLMRSRMAGVWRPGKGVFMKDIGQGRFIFQFFHEVDLKRVYDGGPWAFGNFPLILHRLRRGEFPLTVPLDILPFWVQIHDLPAGYLTEGVGKLLGNFIGKFMEFDSTNTTGVWRQYMRVRVGVRVSEPLKRFKKIKNRDGSTFVVKFKYERLNIFCFLCGRLGHSESFCEMLFNPEARDTERQWGVELKAADRRGVGMAGEKWIRTEDAGANP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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