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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001080`

染色体: Chr06 坐标: 10753351-10754692 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001080`
名称	SmilChr06G001080
描述	uncharacterized SmilChr06G001080
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10753351 - 10754692 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988601`
GeneID	`130988601`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988601`
原始查询	`SmilChr06G001080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0624900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0624900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G46710` (AT5G46710) PLATZ transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834714] identity=30.2; qcov=1.13; evalue=9.79e-22; confidence=low
Rice	`Os06g0624900` - identity=33.6; qcov=0.765; evalue=8.92e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04640 (PLATZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988601

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768467.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768467.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768467.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768467.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10753837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:10753850`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	83	A18,A19,A21,A22,A3,A4,A6,A8,A9,B10,B103,B106,B11,B113,B114,B120,B121,B122,B123,B128,B13,B130,B135,B14,B15,B17,B19,B28,B30,B32,B36,B40,B45,B52,B53,B56,B57,B6,B64,B66,B68,B75,B80,B85,B87,B89,B96,B97,C10,C16,C17,C19,C2,C20,C24,C26,C28,C3,C32,C34,C35,C40,C48,C49,C5,C58,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C84,D3
`Chr6:10753900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr6:10753938`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr6:10753938`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr6:10753973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:10754089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:10754103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:10754134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A13,A23,A24,B107,B118,B12,B3,B59,B71,B93,B98,C5,C62,C74,C77
`Chr6:10754249`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A10,B29,B31,B67,B89,C6,C86
`Chr6:10754408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A16,B50,B60,B88
`Chr6:10754436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A15,A3,A4,B100,B122,B129,B2,B20,B30,B35,B45,B65,B8,B80,B91,B92,B94,C24,C57,C8,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768467.1

187 aa

187

PLATZ

PF04640 PLATZ 64-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768467.1`	Pfam	`PF04640`	PLATZ	Family	64	140	4.8e-18	66.3	PLATZ transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912484.1
ATTTAAGTTGTCGTTGGGGCCTATACTGAAAGTGGGGATGTCAATCGGGCCAATTCTTCGAGTTTCTCGCGCATTTTTTATCGACTTATCAATCAAGTTATAATGCTATTCGGATTAAAATTATTGAGTTAAAAGTTTTTACCTTAATCTTCTCAATTAATGGCCTATTCGGACTAATCTATGTACTTTGGATTGAATTGACATCTCTAATCAAAGTTCAGAAGAGATATAGTATGAAATTATTAGGAATCCACCTTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988601
ATGAAAATTGTGGAGCAATGGTTGAAAGCATGGTTGGATAAGCCGTTTTACGCAGCAGAAAAGTGCACAAGGCATACCAAGCATTACAACACCGTCTTCTGCGTCACGTGTTTGGGAGACCCCTTTTGCGAGTATTGCTGGAAAGACTCCAACCTACACAACCACGATCATCATCAAATTCTGCACGTTCGGCGCGCTTCAGAGAGGACATCTGTTGAAGTGGAAGACATAAAGAAGTTTCTTGACATATCAAAAATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768467.1
MKIVEQWLKAWLDKPFYAAEKCTRHTKHYNTVFCVTCLGDPFCEYCWKDSNLHNHDHHQILHVRRASERTSVEVEDIKKFLDISKIQVYCINKKSIVFLKPHEEGAPDASQKPYCHTCHRRLIKSYQFKEYKFCSIACKVGINKLDMKIEQQPSPPLSMMINNDQRRHFISQRKRSRKGIPHRAPLQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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