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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001084`

染色体: Chr06 坐标: 10841704-10842699 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001084`
名称	SmilChr06G001084
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10841704 - 10842699 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988605`
GeneID	`130988605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988605`
原始查询	`SmilChr06G001084`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT4G09465` (AT4G09465) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008130] identity=44; qcov=0.798; evalue=4.34e-23; confidence=medium
Rice	`Os11g0704600` - identity=42.2; qcov=0.728; evalue=3.07e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057768472.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768472.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768472.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768472.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10841812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr6:10841983`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A19,A20,A21,B104,B105,B112,B113,B132,B133,B31,B57,B65,B8,C23,C3,C39,C7,C71,C77,C79,C9
`Chr6:10841994`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr6:10841994`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr6:10842071`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr6:10842071`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23
`Chr6:10842149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:10842604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr6:10842617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768472.1

114 aa

114

PF07983 X8 35-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768472.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	35	92	2.5e-14	54.4	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912489.1
TAAATTTAATCAAAACGACATATATAATTAACAAATACATCCACTCCGAAGATGAAACTCTCATTGTTCATTGTCATTTTTCAGTTAGGGCTTGTCATTTCCTACGTGGCTGCAGACTCCACCATTTCTGATGCCGTGATTCACCAGAGCAAGACATGGTGCGTGGTGACGGTAGGAGCAGCCGACGAGAAGCTGCAAGCATTTTTGGAGTCAACGTGTAGTGAATTGAATTGCAAAGCAATAAGGGCAGGTGGGTCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988605
ATGAAACTCTCATTGTTCATTGTCATTTTTCAGTTAGGGCTTGTCATTTCCTACGTGGCTGCAGACTCCACCATTTCTGATGCCGTGATTCACCAGAGCAAGACATGGTGCGTGGTGACGGTAGGAGCAGCCGACGAGAAGCTGCAAGCATTTTTGGAGTCAACGTGTAGTGAATTGAATTGCAAAGCAATAAGGGCAGGTGGGTCTTGCTACCAACCAAATACGTTGCAGAATCATGCATCCTACGTTCTCAATCTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768472.1
MKLSLFIVIFQLGLVISYVAADSTISDAVIHQSKTWCVVTVGAADEKLQAFLESTCSELNCKAIRAGGSCYQPNTLQNHASYVLNLFYRARGVCNSQIGTPSINDPSFGRCIYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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