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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001088`

染色体: Chr06 坐标: 10874514-10876453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001088`
名称	SmilChr06G001088
描述	GDSL esterase/lipase At1g54790
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	10874514 - 10876453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988609`
GeneID	`130988609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988609`
原始查询	`SmilChr06G001088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At1g54790
产物	GDSL esterase/lipase At1g54790
Arabidopsis	`AT1G54790` (AT1G54790) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841920] identity=67.1; qcov=0.923; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0401000` (OsGELP66) - identity=66.9; qcov=0.867; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057768480.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057768480.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768480.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768480.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:10874726`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	35	A16,A22,B101,B106,B115,B120,B127,B136,B22,B23,B31,B35,B44,B47,B58,B6,B63,B65,B69,B71,B8,C32,C33,C35,C44,C46,C56,C58,C62,C76,C82,D1,D10,D11,D3
`Chr6:10874729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	194	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B28,B29,B30,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B55,B57,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B71,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C71,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D9
`Chr6:10874744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B24,B36,D5
`Chr6:10874798`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C59
`Chr6:10874798`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C59
`Chr6:10874808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B83
`Chr6:10874821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr6:10874855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B8
`Chr6:10874872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr6:10875009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C14,D10
`Chr6:10875014`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr6:10875014`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768480.1

415 aa

208

415

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 66-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768480.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	66	393	5.2e-48	164.7	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912497.1
TAACACATAACATCAATTGTTACCAGAGATTAAGACATTGCTTCAAAATTTATTCATGTAACAGTAAAGCAGCTCTAAATCTGGAAAGGACAGCCATTGGCTACCTTGTACACTATGACCACCCATAACTTTAAATCCACACTAAAACAAAGCAAGCAACAAAAATGCAACCCTTTTTATTGTATAGGTACAACAAGAGCTCCCATATTCAATATGGCATCCACCACTTGTACCTTCCAACACCTTGCCTTGCTCATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988609
ATGACCACCCATAACTTTAAATCCACACTAAAACAAAGCAAGCAACAAAAATGCAACCCTTTTTATTGTATAGGTACAACAAGAGCTCCCATATTCAATATGGCATCCACCACTTGTACCTTCCAACACCTTGCCTTGCTCATGATCATCATCTTCTCTGCAGCAGCCACCGCCGTTGATTTCAGCTATCCTGCAGTTATCAACTTCGGTGACTCCAATTCCGACACTGGCAACCTAGTGGCCGGCATGGCCGACCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768480.1
MTTHNFKSTLKQSKQQKCNPFYCIGTTRAPIFNMASTTCTFQHLALLMIIIFSAAATAVDFSYPAVINFGDSNSDTGNLVAGMADRLDPPHGQTYFQKPSGRFCDGRLIIDFLMDAMDLPLLNPYLESIAAPVFKRGCNFAAAGATTLPATASSVCPFSFRIQVAQFLRFKAKAVDILTKSRKYDKYLPAQDYFGKALYMFDIGQNDLAGAFYSKTLDQILASIPIVLSEFEDGIKKLYDEGARNFWIHNTGPLGCLPQN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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