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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001104`

染色体: Chr06 坐标: 11149116-11153850 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001104`
名称	SmilChr06G001104
描述	uncharacterized SmilChr06G001104
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11149116 - 11153850 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988624`
GeneID	`130988624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988624`
原始查询	`SmilChr06G001104`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833854]; symbol=AT5G38640; hit=AT5G38640; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833854]; symbol=AT5G38640; hit=AT5G38640; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38640` (AT5G38640) NagB/RpiA/CoA transferase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833854] identity=64.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0617100` - identity=67.1; qcov=0.789; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0044237 (GO:0044237)
KEGG	-
Pfam	PF01008 (IF-2B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057768494.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057768494.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057768494.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768494.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11149640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:11149661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C64
`Chr6:11149661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr6:11149931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr6:11151901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C39,C71
`Chr6:11152198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768494.1

635 aa

318

635

IF-2B

PF01008 IF-2B 326-618 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768494.1`	Pfam	`PF01008`	IF-2B	Family	326	618	7.8e-79	265.5	Initiation factor 2 subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912511.1
GCCAAAATGGAGCGGCATCCTGTGATGAGCCCACCACTACGTTGCGCAACCTTATTGCCTGCAACTCTCGCCCACCTTAACCCTCTGCACCCTACCCTCATCGCATTCCCAATCGAATCCAATCCCAATCCCAATTCCTCGTCTCCGTCTAAACCCCAAACCCTAACCTAACCCCAACCCCACATGGAATCCCGCCGCGTCCCCCGCACCGTCAGCGACCCCAAGGTCCGCCAGGTCGGATTCTTTGCTCCGGCGGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988624
ATGGAATCCCGCCGCGTCCCCCGCACCGTCAGCGACCCCAAGGTCCGCCAGGTCGGATTCTTTGCTCCGGCGGCTCCGCCCGACCGCTCTCAGTCCGGTCCCCCCGACCCCACCTCGCCGCCGCCGCCTGTTTCCGACATTTCCCCCTCCGGCAACTCCTTGTCCCCCGTCATGATCCCGCCTCCTCGCCACCTCTCCACCGACCTCCCCCGCCACTTCCCTCACCCACCGCCGCCGCTCTCCCCGCTCCGCGCCACCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768494.1
MESRRVPRTVSDPKVRQVGFFAPAAPPDRSQSGPPDPTSPPPPVSDISPSGNSLSPVMIPPPRHLSTDLPRHFPHPPPPLSPLRATRANDTSIPVGSYNPSEFSTPSGITDFSEDQLSPRWGRKSSSGKFATSLPSGGFRMAAAKQTSIADSKPGVADGGANVEVQKEKGAAAGKPLKEKTTKAERRAMQEAQRAAKAATKGEGSKSAGVNSANVGKSVKPTPQKKDNSSVAASEKKSGDRQADKDRKKDVPHPRMQFDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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