当前解析结果
SmilChr06G001107| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001107 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001107 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001107 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 11173743 - 11178104 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130988627 |
|---|---|
| GeneID | 130988627 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988627 |
| 原始查询 | SmilChr06G001107 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | dihydroflavonol 4-reductase/flavanone protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821152]; symbol=AT3G02420; hit=AT3G02420; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | dihydroflavonol 4-reductase/flavanone protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821152]; symbol=AT3G02420; hit=AT3G02420; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G02420 (AT3G02420)dihydroflavonol 4-reductase/flavanone protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821152] identity=72.2; qcov=1; evalue=5.84e-180; confidence=high |
| Rice | Os01g0604700- identity=60.9; qcov=0.986; evalue=1.12e-152; confidence=high |
| GO | GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane); GO:0061024 (membrane organization); GO:0071786 (endoplasmic reticulum tubular network organization) |
| KEGG | smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF03661 (TMEM33_Pom33) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988627 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057768497.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057768497.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.80000 | XP_057768497.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057768497.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768497.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:11175886 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768497.1PF03661
TMEM33_Pom33 127-319 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768497.1 |
Pfam | PF03661 |
TMEM33_Pom33 | Family | 127 | 319 | 2.3e-11 | 44.3 | Transmembrane protein 33/Nucleoporin POM33 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。