当前解析结果
SmilChr06G001137| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001137 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001137 |
| 描述 | stress-induced protein KIN2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 11396697 - 11397322 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130988656 |
|---|---|
| GeneID | 130988656 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130988656 |
| 原始查询 | SmilChr06G001137 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | stress-induced protein KIN2-like |
| 产物 | stress-induced protein KIN2-like |
| Arabidopsis | AT5G38760 (AT5G38760)Late embryosis abundant protein (LEA) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833867] identity=63.5; qcov=0.969; evalue=1.15e-20; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF27970 (LEA1_2_D7_KIN2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130988656 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057768541.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057768541.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057768541.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057768541.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057768541.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057768541.1PF27970
LEA1_2_D7_KIN2 5-63 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057768541.1 |
Pfam | PF27970 |
LEA1_2_D7_KIN2 | Family | 5 | 63 | 3.4e-22 | 79.6 | LEA protein 1/2/D7/Stress-induced protein KIN2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。