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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001142`

染色体: Chr06 坐标: 11492651-11497004 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001142`
名称	SmilChr06G001142
描述	transcription factor BIM2-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11492651 - 11497004 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988659`
GeneID	`130988659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988659`
原始查询	`SmilChr06G001142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor BIM2-like
产物	transcription factor BIM2-like
Arabidopsis	`AT1G69010` (BIM2) BES1-interacting Myc-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843233] identity=30.8; qcov=0.735; evalue=3.15e-11; confidence=low
Rice	`Os09g0475400` (OsbHLH032) - identity=30.3; qcov=0.725; evalue=5.02e-14; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057768546.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768546.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057768546.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057768546.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057768546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11493762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:11493768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:11493820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:11494817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:11495773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:11495946`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A16,B129,B130,B134,B45,B74,B95,C28,C59,C70,D7
`Chr6:11496733`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A13,B101,B12,B125,B129,B130,B134,B45,B74,B95,C11,C28,C59,C69,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768546.1

373 aa

186

373

HLH

PF00010 HLH 33-82 aa

XP_057768547.1

337 aa

168

337

HLH

PF00010 HLH 33-82 aa

XP_057768548.1

304 aa

152

304

HLH

PF00010 HLH 33-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768546.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	33	82	3.6e-16	59.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057768547.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	33	82	2e-16	60.2	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057768548.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	33	82	1.8e-16	60.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912568.1
CTGGCCAAGGAGGAGGTAAGGCATGACAAATAAATGGCCAATCAACAGTGGCGCCGTTTAGCGTAAGCGTCACCGAGCACGCGCAGTTTAGCACTCACCACCGCGCGAAATTTCCAGCACAGGAGGCGTTACCCTAGAGCGCTTCTTAATCAACCTCCAGCTCGAACAATATTCACCGCCCCTCCTCTAACACGCTAGCGCAAGTATATTGGAACAGAATTGGATTTGCAGCAAGAAATGGGAAGAACTGCGAGCCACGT...

XM_057912563.1
TGGCCAAGGAGGAGGTAAGGCATGACAAATAAATGGCCAATCAACAGTGGCGCCGTTTAGCGTAAGCGTCACCGAGCACGCGCAGTTTAGCACTCACCACCGCGCGAAATTTCCAGCACAGGAGGCGTTACCCTAGAGCGCTTCTTAATCAACCTCCAGCTCGAACAATATTCACCGCCCCTCCTCTAACACGCTAGCGCAAGTATATTGGAACAGAATTGGATTTGCAGCAAGAAATGGGAAGAACTGCGAGCCACGTA...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130988659
ATGGGAAGAACTGCGAGCCACGTAGAAGACGAAGAAACTCACGATAGCTCTTCCCCTACAGACTACAAAAGAGTTGATCAGAAGGCAAACGCTTTACGTTCCAAGCATTCAGAGACGGAGCAACGCAGAAGGAGCAAAATCAATGAGAGATTTCAAATTTTGAGGGACCTGATACCCGAAAATGATCAAAAAAGGGATAAAGCTTCGTTTTTGTTGGAGGTTATACAGTATATCCAGTTCTTACAGGAGAAGTTGCAGAT...

LOC130988659
ATGTATGAGGGATCTTGTCAAGGTTGGAGCTCAGAGTCCACAAAGTGTTTGCCGCTGAGAATTAATTCTGGGCCAGATGAAAGCTTCGTTGACCAGACCCAATTTGAAAGGAACTTTTATGGTCACGAAGACAATGTTCACCCAGTCCTGCTAAGTAATGCGCAGAACTCAGTGGAATCGGACTTAACTGGAGTTACCTTATATAAATCAGCAGTTAACCCACCCATGACAACACAAGCCCTTGCTATGGCCATGCCTCT...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057768546.1
MGRTASHVEDEETHDSSSPTDYKRVDQKANALRSKHSETEQRRRSKINERFQILRDLIPENDQKRDKASFLLEVIQYIQFLQEKLQMYEGSCQGWSSESTKCLPLRINSGPDESFVDQTQFERNFYGHEDNVHPVLLSNAQNSVESDLTGVTLYKSAVNPPMTTQALAMAMPLPAAIFESLPGQPHQGSFTEADQLNFWQGRSCADDCSVPVYSANGEELKSESGEASISNVYSQGLLNSLKCSLQSSGVDLSQTNISVQ...

XP_057768547.1
MGRTASHVEDEETHDSSSPTDYKRVDQKANALRSKHSETEQRRRSKINERFQILRDLIPENDQKRDKASFLLEVIQYIQFLQEKLQMYEGSCQGWSSESTKCLPLRINSGPDESFVDQTQFERNFYGHEDNVHPVLLSNAQNSVESDLTGVTLYKSAVNPPMTTQALAMAMPLPAAIFESLPGQPHQGSFTEADQLNFWQGRSCADDCSVPVYSANGEELKSESGEASISNVYSQGLLNSLKCSLQSSGVDLSQTNISVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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