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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001144`

染色体: Chr06 坐标: 11536254-11547518 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001144`
名称	SmilChr06G001144
描述	DNA-directed RNA polymerase 2B, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	11536254 - 11547518 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130988662`
GeneID	`130988662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130988662`
原始查询	`SmilChr06G001144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase 2B, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	DNA-directed RNA polymerase 2B%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G15700` (AT5G15700) DNA/RNA polymerases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831424] identity=63; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0246200` (OsRpoTm) - identity=75.5; qcov=0.815; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0006390 (mitochondrial transcription); GO:0034245 (mitochondrial DNA-directed RNA polymerase complex)
KEGG	-
Pfam	PF00940 (RNA_pol); PF14700 (RPOL_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130988662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057768554.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057768554.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057768554.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057768554.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057768554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:11536481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B52,B70,B71,C62
`Chr6:11536591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:11536657`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	91	A10,A11,A13,A14,A2,A23,A25,A3,A5,A6,A7,B100,B102,B103,B107,B108,B120,B124,B136,B137,B138,B139,B140,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B32,B34,B36,B37,B45,B46,B5,B50,B53,B58,B59,B60,B62,B63,B64,B66,B73,B75,B78,B81,B82,B83,B85,B88,B94,C17,C21,C22,C26,C30,C33,C35,C36,C37,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C53,C58,C59,C6,C64,C66,C7,C70,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C85,C86
`Chr6:11536667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:11536694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B53
`Chr6:11536728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr6:11536816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:11537041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr6:11537043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:11539142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr6:11541333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:11543123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057768554.1

1038 aa

519

1038

RPOL_N

RNA_pol

PF14700 RPOL_N 204-524 aa PF00940 RNA_pol 647-1012 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057768554.1`	Pfam	`PF14700`	RPOL_N	Domain	204	524	3.8e-82	277.1	DNA-directed RNA polymerase N-terminal
`XP_057768554.1`	Pfam	`PF00940`	RNA_pol	Family	647	1012	5.5e-165	550.3	DNA-dependent RNA polymerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057912571.1
CCATCACTGCTTCTACTATCACTCTTCTGAAAATTTCTGATTCTCGACATTTTGTAAGTGAAGTGCTCTTTCCTCCAACAACTGATCAATCTCAGTCTCTCCCCACTGCTTCTCCAATGTTGCCAAATCTCTAGTTTTCTTTTTCATCTCATATTCTTGGTCGGTATTTGATGTACAGCAGTGCAACCCCAATTTCTATCGGCTTCAACACAAACAATTCTTCATTGCGTAATCCAGTATTAAGTGTCGGCGTCCACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130988662
ATGTACAGCAGTGCAACCCCAATTTCTATCGGCTTCAACACAAACAATTCTTCATTGCGTAATCCAGTATTAAGTGTCGGCGTCCACAAAAATAGCCCCACAGATATGTGGAGAAACATCGCCAAACAAATCAGTTCAAGAGGGCGGCCGGAATACCGCCGCAATTCGTCTCTCTCCGCCACTCAAAGCTTTCTGGGGTTCGGCCAGGATCCACTTATTCCCGGAAAACCAAAGTTCAGGCGCCTCTTCGAGCTTAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057768554.1
MYSSATPISIGFNTNNSSLRNPVLSVGVHKNSPTDMWRNIAKQISSRGRPEYRRNSSLSATQSFLGFGQDPLIPGKPKFRRLFELNLRPADAFPMVGFRRNGDIDGPDENFPSFFGRNQVNCSVLCCRSYASVAEAVEVEVAASHTDADEDNRDTSRADMSAPDEVQELLNVMRKEEMRVYAKNWRHKIHAKMGIKKYYALKRRQAKMETEAWQQAAKEYVELLNDMCEQKLAPNLPYMKSLFLGWFEPLRDKIAEEQEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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